Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RNF169_0002300
Sequence Length
361 nt
GC Content
0.4515
AGAAGAAAAGUUACAAGAGGAAAAACCCUCUGAAGAUCAAAUCCACAAGCUGUUACCAGAGGAUACAGAAACAGGGAAAAGGAAAAUGGAUGAACAGAAAAAAAGAGAUGAACCAUUAGUACUGAAAACAAAUCUGGAACGUUGUCCUGCACGUCUCUCAGAUUCAGAGAAUGAAGAACCUUCUCGAGGCCAGAUGACACAGACACAUCGCUCGGCAUUUGUUUCCAAGAACAACUCCUACUCCUUAGCUUUCCUGGCAGGGAAGCUAAACUCCAAGGUGGAAAGGAGUCAGAGCUGUAGUGACACAGCCCAGGAAAGAGCGAAGAGCAGAGUCAGAGCAGUUCCAGGCAACAAAGCCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-81.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -87.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 80.23
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..........(((((......)))))..........(((.....((((..((...))..))))......))).......(((((.......................)))))....((((......(((((((((((.((...)))))).)).)))))))))............)))))(..(((..((((.........))))))).(((.((((((.((..((((..(((..((((.(((((((((((...)))))))))))(((((..........)))))..(.(((((......))))).)........((.....)).))))..)))..))))..)).)))))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((....,,,...(((((......))))).....,,...(((.....((((..((...))..))))......)))....,..(((((.,...,.............,...)))))....{{{,......(((((((((({,((...}})))).)).)))))||}}..,.,}......)))))({{{{{..((((.........)))))))}(((.((((((.((..((((..(((..((((.(((((((((((...))))))))))}{((((..........)))))..(.(((((......})))).}........{{.....)).)}))..)))..))))..)).}))))))))..)
Back