Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RNF169_0002400
Sequence Length
1293 nt
GC Content
0.4230
GAUCACUGGAGCCUUGGCAACAUAGUGAGACUCUGUCUCUAAAAAGCAAAGAGGAUGAUAUUUAAUAGAGACAACCUUAUGGACUAUAAGUGUCUGAUUUGUUAGAUUUUUAAAAAUACGUUAAAAAUUAACUUAAAGAUUCCCAUUAUUAGCUUGUGAAACCCCCCUUAGAAUGUAGGGUCCCAGUUUGAGAACCGUUGGCCCAGAGAUAACCAGAACAUGAGUAAAAUGUUCAUAACUCAUAAUUUACUGUUUCAGGUGCAUCAUUUUAUUUUAUAAGGAAAAACCUGUUACCUCUUGUCAGGAGAAAGAUUAAUUAAACACCGUGAGACUGUAUGGUUCUACAGCGCUCCCAAAUUAUUUCUUUAGUAUACUAUUAUUGGAUGGUGGUCCAUUUAACCAGUUGAGAUAAGAAAAUCAGAAAAUUAUGGAUAUAUAAGCUCUAGUCUUUAAAGUACCAUUGAGAAGCACUGCCCCCUAUAAGCCCUAUACCCAUGGCACUGUCUGGUUGGUUACCUUUUACAGUGGAAUUGAGAGUACAGUAGUUCAUCACAAAGCAUGGAACAGUCACCACAAUAGGUAUGGUUUGUGUCAAAAAAUAUCUUUGUUGGAAGGACCUUUUAUAAAAAUCAGUUAGUCCAGGCUGGGCGUGGUGUCUCACGCUUGUAAUUCCAGCACUUUGGGAGGCCGAGGCAAGCGGAUCACCUGAGGUCAGGAGUUUGAGACCAGACUGGCCAACAUGGCAAAACCUCGUCUUUAAAAAUACAAAAAUUAGCCAGGCGCGAUGGUGCACAGCUGUAAUCCCAGCUACUUGGGAGGCUGAGGCACAAGACUGGCUUGAACCCGAGAGGUGGAGGUUGCAGUGAGCCAAGAUCAUGCCAUUGUGCUCCAGCCUGGGCAACAGAGUGAGAUUCUGUCUCAAAAGAAAAUCAGUCCAAUCUUACUUCAACAGCAUUCUGCUUGUGAGCAACUUUGUCAUUUUUGGUCAAGACUAUAGUCUCAGCACUAAAAAAUUGCCUAACAUAUAGAAUCUGAUGCACUGUAAAUAUUUGCGGAACUGAGCUUAUUGAACACAGACCCUGUAUCUGGAACUCAAGUAGGGGAGUGGAAAUCAAGGAUGCAUAGGUUGCUGAUUAAAAAAAGCUCACAGUAUCUGGGGGAAAAGGGAUUUGAAAACAAGUAAUUGAACACAAGUAAUUUUUUUUGGGGGGGGGUGGGGACGGAGUCUUGCUCUGUCGCCCAGGCUGGAGUGCAUUGGGGCAAUCUCGGCUCACCGCAAGCUCCGCCUCCCGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-384.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -408.28
Frequency: 0.0000
Diversity: 318.51
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((((..((((((((.(((..(((((((.....((((.........))))((((.(((((..(((((((...((((((..((((((...(((((((((((.(((((((((.......))))))))))))(((((((...........((((((((.((((..............(((((...(((....)))....))))).(((.((....((((((.......)))))).)).)))......(((.((((((((((.............((..(((.....)))..)).(((((...)))))..............)))).)))))).))).)))).))))).)))...........)))))))..........((((((((....))))))))...............))))))))...))))))...)))))).....)))))))))))).))))....(.(((.((((......((((......(((((.((((((..(((.....)))....))))))((((((.........)))))).........)))))........((((((.((((((..((((...))))..))))))))).)))..((((...................)))).))))))))))).))))))))...)))..((((((....)))))).))))))))...)))....((((....))))((((((....)))))).((((...)))).............................((((((........((((.(((((....((((((....)))))))))))..))))....))))))))).)(((.(((((((((.((((.(((((((.((((..(.(((.(((((((((((((((((.((((((((((((((((((((..........((.(((..(((.....((.(((.((((((..(((..((((........(((((((((.((((....))))..).)))))))).))))...)))..))))))))).))..((((((....))))))...(((((((.((((.((..((((.(((((((.((((((........)))).....))..)))))))..))))..)).))))...)))))))(((...))).((((((((..(((((....(((....)))....)))))..)))))))))))..))).)))))))))))))))))))))).))))))))))))))))).))).)..)))).))))))).)))).))))))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((({({..((((((((..,,..((((((({{({{((((.....,,..,,,,,,{,.,,{{{..{((((((...((((((..((((((...((((((({{((,(((((((((.......)))))))))))),{{{{{{...........{(({{({{.{{{{.{{{{........}))),..,,{{{,,,{{||{{,{||,,,.,,,....,,.((((((.......))))))....,}}......(((.((((((((((......,..,,,,{,..(((.....)))..,,.(((({...})))).,,,,,........)))).)))))).))).)))),)}))),}}}...,,......||||}},,..,{{....{(((((((....))))}}}}..}}}..,..,},,,))))))))...))))))...)))))),..,.))))))},}}}}{|||{((({,({{{{((({({....{(((.,......|{|}|{{|||..||{.}}}.,})}}}},)))))|.,||{}}}}.}}}},}}}}}.}|}|..,,|||||,,,.,{{.((((({.((((((..((((...))))..))))))}))}}))..{|||..............,}...)))).)))))||{||||,,}}))))))}}},..{|||||...,}))))).))))))))...}}}....((((....)))){{((((,,,,}||}}}.((({...}))).....}}.}}}},................((((((.,......((((.(((((....((((({....}))))))))))..))))..}.))))))))).)(((.(((((((((.((((.(((((((.((((..(.(((.(((((((((((((((((.((((((((((((((((((({....,.....,..,((,,(((..((((({.{{.,,,.((((((((.,(((.{{{,,..{((((((({.((((....))))..}.)))))))}.||,|{{..|,..||||,,|||.,,..((((((....))))))...(((((((.((((.((..((((.(((((((.((((((........)))).....))..)))))))..))))..)).))))...)))))))|})..}))),,,|,,,||,.|{{{{...,||}}...)))..)))))))}.,,,,},)))))).,))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))).))).)..)))).))))))).)))).))))))))).)))
Back