Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RNF20_0003100
Sequence Length
735 nt
GC Content
0.3170
GUAUGUCCCUUCUAUGCUGAUUUUGCUAGAGUUUUAAUCAUAAAAGGAUGCUGGAUUUUGUCAAAUGCUUUUUCUGCAUCUAUUGAGAUGAUCAUGUGAUUUUUUAAAAAUUCUGUUUAUAUGGUGUAUCAGAUUUAUUGACUUGUGGAUGUCAAACCAUCCCUGUAUCCCUGGUGUGAGACCCACUUGAUCAUGGUGGACUAUCUUUUUGAUAUGCUUUUUGAAGGCAGUGUGAGAAACUGUUAGAAUGGUUACCUCUACAUAUUGGGAUGAGUUGUGGGUGAGGUUAGGAGGUGGGUGUUUGUGAUUUUACUUUUUACACUUUAAUAUUGUUUGAUUCUACUUUGUGCAUUAAUUUCAAAAAAGACUCUUUUAGAAUGUCUAGCCAUUCUGAAGGAAAUACUCUUGGACUUUUGUUUGAGUUCUAAUUUAUAUGUUAUAGUAUGAAUUGCCAGGUUUUAAGCAUUAGCAUGCAUUCUCUAUUUUUGGCAAUUUGGAAAAGAAUCUUUUCAGUCAUUUUUCAGACUCUUACUGAAUCUUCCACAAUAUUUUAUAUUAAAAGUAAAGCUUUCAGUUAUCAUAGUCUUGAUGUAUUUUGAAGGGUUCAUGGGCAAAAUCAGUAAUAGUUUGAGAUUUCUAACAUACUGUAUUUUGUGGGCUUAUAGAUUAACAGAAUAGUUUUUUUUCUUUUUUUAAUCUUUUCAUUUGUGUUAAAAUCUGAUUUUCUGUUCAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-155.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -171.65
Frequency: 0.0000
Diversity: 198.63
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(......)(((...(((((((((((((((((((((.....(((((((.(((..((((.(.((((((((.......))))...)))).).))))..))).))))))))))))))).............((((.(..((((.((((.(.(((.(((..((((..((.((((((..(((((((..(((((.......)))))..((((.....)))).(((.(((...((((((.......)))))).))).)))...))).))))...))))))))..)))).))).))).).)))).))))..).))))(((((((((........((((((((..(((((((((....((((................((((((((((((......)))))))))))).........((((((......))))))........))))...)))).(((((((((((......((((....))))..........))))))))))).((((((...))))))((((........))))......)))))....)))))))).......))))))))).(((((((.(((((......)))))....))))))).......)))))))))))))((((..(.((((((.(((((((.........(((((.....(((((((.((((.((........))))))))))))).))))).))))))))))))).)....))))...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(......)(({{{{(((((((((((((,{{{{{{,,{{{,((({,((((((.{((,...,(,,,,,||....}}.))))}}.}}}},|,||||{{|||{,},,,,,,,,,,,,,..,}}}}}}}}.,|||{.{..((((.((((.(.(((.(((..((((..((.((((((.,(((((((,.(((((.......))))).,{{{{,,{{{,|||((((({...}))))},|}}.}}}||||||..,.}}))),..}))},)))}},))))))))..)))).))).))}.}.)))).)))).,),))))|{(((((((........((((((((..(((((,,{{,{,.,.,.......,,...,,}..((((((((((((......))))))))))))......,,,((((((......)))))).,,,,{{{{{,....,)))}||(((((((((....,.((((....)))).,........}))))))))}}.((((((...))))))((((........))))......)))))....)))))))).......))))))))|.(((((({.(((((......)))))....})))))).},....))))))))))))}||||..{.((((({.(((((({,,,,.....|{||,...,.{((((((.((((.{{.......,}},}},}}))))}...,,..}))))))))))))|}....}}},}..}))
Back