Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_RNU6-541P_0000200

Sequence Length

695 nt

GC Content

0.3683

GUUCCAUCUUCAACAUUCUGCCAGUCCUGUCAAUCAAUGCAGUUUCACCAGGUGCACGUUCCAACCGAAAUCGUAAUCUCCUUGUAAGUAUCUGGAGGUUAUAUGUGGAUCCUGGUGUAUCAUACAAAUGGAGAGGUAGACGUUCAAUAGAUUCUAGUACAGCUAUUAACUUUCGAAUUAACGCAACUGCUGGUCGACUUUCAUCAUCUUCAUUUUCACUAAAGGCAGUUUUAAAAACAUUCUUUCUACCAGUUGAAAUAAUUUUUAAAACUGUAUUUUUUUCUUUACUACUUGAUAAACUUACAUUGUUUAACACAGUAAGAAGUGCUUGUACCAAGCCACUGCUACACAUUUCAUAUGGUGAAAUUGUGUUUUCAUCCUUCAAAAGUACAAUUAGGUUUUCUAAAGCUGUCUUCAUUAAAUCUCUCCAAGUGUUCUCACUCUCAAUACAUUGUCUAUUUGUAUGAAGUUCCCAAGAUGACUCUAACUGAGUUGCUAUGUUUCUGAGUGUUACCACUACUCCACGAGGCAUGCUUUCAACAGCUUUAAAAUGGUCAUCGUAUAAAUCUCGAGCCAUAGUUCGUACCUUUUGCUUUGUUUUUUCUAACUUAGAUUUCAGUUUUCUGCCUCUUUUGCCAGUCCAGCCAGUCACAAAUUCUGAACCCAGGGAAGUUUCUGCAGUAAAUGAAUGUUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-141.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -157.23

Frequency: 0.0000

Diversity: 146.41

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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