Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_RP1-168P16.2_0000300

Sequence Length

503 nt

GC Content

0.5666

GGGAGGGAUGGGGCACGGCCAGGAGACUCUGGGAGGCAUCUCAGCCCAGUAGCUGGCUGAGGGGAGGGAUGGGGCACGGCCAGGAGACUCUGGGAGACAUCUCAGCCCAGUACCUGGCUGAGGGGAGGGAUGGGGCACGGCCAGGAGACUCUGGGAGGCAUCUCAGCCCAGUACCUGGCUGAGGGGAGGGAUGGGGCACGGCCAGGAGACUCUGGGAGGCAUCUCACCCCAGUACCUGGCUGAGGGGAGGGAUGGAACAUGGCCAGGAGACUCUGGGAGGCAUCUUCGUUACUGGCCAUUGGAUUCCUCAAGUUCUGCUGAGAAUUCUAGUCUCUUUUUUUCCCCACUCUAGAAUAAGGAUCUUAAUUAUUUAUUUGUGUUGUCCAUUGGGAAAAAUGAUUUGGGAUGUGCUUACUGUCAACAAGGGGAUAGUGGUGGGUUCCGAAUGUAAACUGGCCGUAAUCCCAGCACUCUGGGAGGCUGAGGUGGGAGGAUUGCCUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-192.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -201.09

Frequency: 0.0000

Diversity: 149.69

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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