Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RP1-68D18.2_0000100
Sequence Length
403 nt
GC Content
0.3921
GCUGGUCUCGAACUCCUGACCUCAAGUGAUCCACCAGCCUCAGCCUCCCAAAGUGCUAGGAUUACAGACGUGAGCCACCACGCCCAGCCAUGAAUUUAAAGUUUAAAUGGCAAUUUUAAUAGUCACAGUACCCUAGAAUGCUUAUAGCCUAAUGUUAGUAAAUCAAAUGCUUUUUACAAGACUGAUAUUCACAGACACUGAUUCUUUCUGAUUUCCACAGUGGUACGGACAGAUUUUCCAUAAUUCUCCAUGGAUUAGACAAUUAAGUCACCCAAUUCUCAUCCUUGGUUUUCUUCAAAAACACUCACCCACAUAAAUCUCAUUUAUGUCUAUACAUUUUUCUCAGUCUUUACGCUUAAUGUUAAGAACUAAAGCAUUUGUUGAAGCAAGCGGAUCACUUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-83.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -90.65
Frequency: 0.0000
Diversity: 66.79
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((.........)).).)((((((((((((.(..((.(((((........(((((..(((((....((((......))))....(((((...............)))))........)))))..)))))....((((((((.(((..(((((((((((((..........)))))((((((((......(((...)))..(((.((((....(((...)))..)))).)))...(((((........)))))...(((......)))..((((.........))))......................((((((((...)))))))).............))))))))......))))))))....)))))))))))))))).))..).))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.((.........)).).)((((((((((((.(..((.(((((........(((((..(((((..{.((((......))))....((((({(({,...,}}))..}))))........)))))..)))))....{(((((({.(({..{{{{{{{{(({{{...,,.,...}}}}}((((((((......,,{...|}|..(({.((((....({,...}))..)))).))}...{((((........)))))..,(((......)))...,,..........,})|{,,,.....},,,,........((((((((...)))))))).............))))))))....,.}}}})))),)..}})))))))))))))).))..).))))))))))))
Back