Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_RP11-269F20.1_0000100

Sequence Length

657 nt

GC Content

0.4064

AGACUUAUUCUCGUCCACUUGCAGAGUAGGAAAAUUGAGGGAAAUGCGGCCGCCUCUCAUUGUCCAUGCAGUCCAUACCAUCCUCAUCAUAUUUUUCAGGUGGUGUUAUUGUAAUAGUCUGAGCUGUAAAUUCUUCAUCAAAAUAUCUAGUAUCUGUCUCAGAUGUUACUUGAGGUUUAAAAGGAGGUACAAGCUUUUUAUCAUAUACAUCUUGCCAGUUUACUCCAGAGAAGAAACUGUGUCUCAUAAUUUCUUUUGCAUCAUCUGGUCCUCCACCAAGGCGUUUAUUUGGAUCCUUUAUCAAGAGCCCUGAAAGCAAUGAUUUUGCAUCUGAAGAGAGUGUUCGAGGAAAUUUAAUGUCUUCCAUUAAUAUUAAUUCAAAAAGUUUCUCAUGGUCCUGGUUGUAGAAAGGUAACCUCCCACACAUCAUUUCAUACAUGACAACCCCUAGGCCCCACCAGUCUACUGCUCGGCCAUAGUCAUUAUCUUCUAACACCUCUGGUGCCAGAUAUUCUGGAGUGCCACAGAAUGUCUUCAUGGUGGCUGCAUCUGUGAUCCCUUCUUUGCAAAGUCCAAAAUCUGUAAUUUUUAUGUGGCCAUCUUUGUCCAGCAUUAGAUUCUCCAACUUGAGAUCACGGUACACAAUCUUUCCGGAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-149.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -161.79

Frequency: 0.0000

Diversity: 126.59

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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