Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_RP11-275F13.3_0000100

Sequence Length

1844 nt

GC Content

0.4197

GUGAAUUUGUCUGACUGGGUUACGGCUUUUAUAAGAAAAAAAAAAAAAGACGAAUCUGUAAUGAAGAAAAAAAAAAAAUCCUAAAAUUUUGUCACAUUUACAGGAAUCUCAAACCUUUUGUAUUCCCAUGCUCACAGGUAGUUUUGAUACACAUUGUAAAUAGUUUCAGUAUUCAGGAAGAAGAAUACUAUAUUGUUGCCAAAGAACAAGAGAAUUCUUCAUGCUUCUGAUAUCUCAGAUUUGCUGAGUGCAAUAGCCAGUUCUAAGUCUUCUUGUUCCUGCUGAUUUAGUCGGGCAAGCCUCUGCUCUUCCUCUCUCUCACUUUCCCUCUUGGCCCAUUCGAUCAUAUCUUCUUCAGAGGGAUAAGCACUGAAGUUGGCAAAAUUGCUUGGAUCAGCCUCUUUAUUGGUAGUGGUAGUAGCAGAAGUGAAUGGAUCACAAAAUAUUUCAGGAUCUUUUUCUUUGGGGCUAUCGUUGCCUGGGAAAGGCUGAAAUGGAUCAUUCAGUUUAAAGGGAUCAGGAGAAUCCAAUUUGUUGAUGGAUCUUUUCCCAGGUGGUAGAGGGCAGGGUCUUGUUGGAGUUCCGAUCUUUGGUGGCAGUGCUGGGGGUUCAUCUUCACUUUUGACCGAUGUUUCCUCAAAUACAUUUUUUGUAAUCACUACGUUGCUGACAGAGCUCGAUGUGGCUGAACGAAAAGGAUCUUCAUUGUUGACCUUUGACAAUGUGCUGAAGUCAGCAAAUCCACCUCCAAAUGAUUCAUUCCCAAAAACAGAAGCAAAGGGGUCUGUGGCUGAAUCGCUUGCUGCAACAACUGUUCCACCAGGAGCAAAAGGAUCAUUGUGCUUCAACGUUUCUACCGAUGUAAUACUGCUAUUGUUGGCUGCACUGAAAGGGUCAGUGCUUGAAGUGGCAAAAGGAUCAGUAGAUUGCCUGAAGAAACAGUCUGAUGCAAAUGGAUCUGAACCUUUGAAAGGAUCACCACCAAAUGGAUCGAUUUUUCCAAAAGGAUCAUCCUUGAAAGGAUCACUGCCAACAAAAGGAUCAGACUGGAAAAAAUCCAAGUUUGUAUCUGCAACUGGACCUGUCAGCGAACUUGAGUCUACAUUAAAUGGAUCUUCCUCUUUUGAAUGUCUAUUAUUGUCGAGUUCAGAACAAACUUUUUCAGUAACAGCUGUAGUCACCUCAUUUUCAUCAGUCACACCAGAAGGCAGUAGUUCAGGACUACUUCUUGCUGGAGAUUCCUGGUGUAUGGGCUCAGACUCUAGGUUGCUCUGGCCUUCAACAUGUUCAUUAAGGUUGGCUGUUUCACUGCUGCUGGUGCUGAGGCUGCAAUAAUCUGUAGCUCCGUUUACAAGAAUGCUGUGUGGGCUACUGCACCAAUUUAACUGACUAUUAUGAUUUUCCAAAUCUUUCAUUUCCAUCAGUUUCAUUUGCAUUGAACUAAUUUCCUGUUGUGAAUCUUGUAGGUGCUGCUGAAGAGGUUCCAACUGAGCCUUCCCUGACUCUACACUCUCCUCCAAUUCUGCUGUUUCUUGCUGUAGACGGCUCAGCUCUUCUCUAGCUUUUGCCAAUUCUUCUUCGUAAGUGGAGAUCUGCGAUUCCUGACUAGUUAAUUCAGCUUUCAGAGAAGAGAUCAGUUGGGCCUCCUCAGCACAUUUCUUUCUGACUUCCUUGAGUUGCUCCUCCAGCUGGGCUUUCUGCUCAUCCAGUUCAUCAAGGAGUUCCUGUACCUGCUGUUUCUGGGCCUGUAGUUUUUGCAGAUUAGUAUUCUCCCUUUGAACUUCAUCUUGAAGAUCCUGAACCUCACUUGUCCUCUGUUUAAUAGUAUCUUCCUUCUCCUUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-508.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -542.88

Frequency: 0.0000

Diversity: 467.53

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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