Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_RP11-4N23.1_0000300

Sequence Length

701 nt

GC Content

0.5221

GUGGAUGGGCUGGGGAUCUGAGAGUCAAGAGGAAGGAGAGCCGGCCCCAGGGAGGAGUGUGGAGUCUGGGCCUCGCAGAGCUGAGGCAAGCCUGAGUCGUCGGUGCUCCCUGGAGAGGACAUCACACAGGAAAGCUAUGACCAUUUCCCCUCUGCCAUGUGACUUUGGGAGGGGUGCAGCUGUGAAUUUGCAACGCAACCCCAUAGUGGAUGCAUAUCAUGUUUCCAUCAUCACCCCCUUACACACGUGCGCUCACACACACGCUCACACACAUGUGCACAGGCACACACACGCAUCAGUCAUUGUGGCUAAGUGUAAUUCUGAUGCUGUUGGAGCACUGGCUCCUGUCACGUGGAGGAAAAGAGAUUUCCCCUAGGGACAAGAGCUCACUGCCCCAUCCCUUCUCUGAUCUCCACUGUAACAUUGCCUCUAGCUCCCUUGAAAUGUUUCCACAAGCGUCAGGGCUACUCUGAAGUAUUAAUGCUGGGAUAGUCACUGGGUAACAAAGCUCCCAUAAAUCUAUUCCCUCUGCUCCAACAAUUUUGCCCCUCACUUCCCACAAAUUCCUUUAACAAAUAGGCGUACCCAGGUUACCCCAUUAACCAGGGGUGGGAGCCAGUCUGAAGGAGGGGAGAUCUGAGGCAGGGUAAAUGGAAGUCACAUUGUUUUCUGCACAUCUUCCAAAGAGUGGAUUCCGGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-231.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -243.89

Frequency: 0.0000

Diversity: 154.34

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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