Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_RP11-505P4.6_0000200

Sequence Length

1685 nt

GC Content

0.4267

ACUUUUAAUUUGGUAGACUUAAUAGGCAAAGUCCCUAUGAGUAGGCAAAUCUGCAUGUUGAGUUUUAUUCCAGGUUCAGUUUUAGGUUCACUGUCUCUCUCUUUGAUGAACACUGCACAAAGUUAUUUGUAUUACAGCUCCUUAAAGAAAGAGUACAAAUUGUUUACGACUAGUUUUUUCAUAUACACGAAAAAGCACAAUUAUAAUUUCUGUCCCACUCAGAAAUUAAUGGCAAACCCAUAGUAACCUAAUAAAGCUAUUUUAACAUGUGCUAAAUAAUUCUUUUAUCUAUACUGUUGUAUUGAUCAAAUUAUUUAUAUGCUCUUUAAAAAUCUUUUAUGAAUUGAAAGCUAUAACUCUCUCUCUUGAAGUCUGUCUGCAUCACAUAAGUAUUGAUCAGUCUUGGAUGAUUCAUUCAUAGCCGACUGUCUUCGUUGAGUGGUCUUCACAAAUCUCAGCAGAUUGAUGAUGGCGGCAGGUGUUACUCCGGGUAUGCGACUAGCAGCCCCGAUCGUCUGUGGACGACUAAAAUGUAGUUUCUCUCGAACUUCAUGGGACAAAGACACAUCCCUGAUAGUCAAAUAAUCUAGGUCUUUUGGCAGUUGGAGAGCUUCAUCUUGCUGAACUCCCUUUAUUUCUUGUAGUUGAUGGAACAACACUGAUUCAUAAGUGGCUUCUAUUUUCAGUCUUUCAGCCAGCUCUCUACAUUUAGUAUACUUCUUCAAGGGCUCUGGAACAGCCUUGGCUAAUGAAUCCAUGUCAACUUCCUCAUACUUCAGAACAUCGAGAGCUCUGACAGGCAGACUUCUACUAGUACUUAUAGAAGCCUCUGGGAUUAAUUUUUUCCAUUUAGAGCUCAAAAACUCAAUAGAUUUCAACACAGAAAUGCCUUCUUCUAAAGAAGACUUCAUCCAACAAGCUCUUUCAUAUCGUUGUUGGGACACACAGCCAGCGUCUUUAUACCCUCGCAGUGUGAGCCGGCUGUCAGCAUUAUCAGGGCGCAGUGACAAACGGAACUCUACUCGGCUGGUAAACAUGCGGUAUGGUUCACUGGUGCCCAGAGUAGUGAGGUCAUCAAUCAAGACUCCUAUGUAACCUUCUGUUCGGCUAACCACAAAGGGAGGCUUGCGACUGACCCGAAGACUGGCGUUGAUUCCGGCUAUCACACCCUGGGUGUUGUGGUGCAUGCCUGCAGUCCCAGCUACUAGGGAGGGCUGAGGCAGGAGGAUCGCUUGAAGCUGGGAGAUCAUAUCACUGCACUCCAGCCUGGCAACAGAGCAACACUCUGUUUGAGCUGCAGCUUCCUCAUAACCAGUGGUGCCAUUGAUCUGUCCAGCAAAGAAGAGUCGUUGAACCAAAUGAGUCUCCAAGGAAGGGGUGAUCUGACGGGGAUCUAAGUAAUCAUACUGAACACCGUAGCCUGGCUGAAUCACUUUAGCUUUCUCCAAGCCUCUGAUGCAUGUGAUCAUUUUCUCUUGUAACUCAGCUGGUAGCGUCAUAGAUAACCCCUGUGGGUAGAUAAGGUCAGAAUCCAUUCCUUCAGGUUCCAACCAAACCUGAUGUAGACGGUUUGGAAAACGCAAAACUUUUGAUUCAAUGGAGGGACAGUAUCGAGGUCCUCUUGUCGUUUCUUUAACAUGACUAUUAAGGUGAAGGUUCUUAAGGACAAUCUCAUCCACUCUAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-460.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -492.66

Frequency: 0.0000

Diversity: 465.20

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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