Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_RP11-505P4.6_0000300

Sequence Length

687 nt

GC Content

0.4163

GUGUUGCAAUGCUCUUAGCUGAGGACCACACUUUUGAAAAGCACAGAAGCUAACACUGUGCUGGUCCAACAGUAAUAAUGGAUCUGUUGUCUAUUCAUAAUUUGCACAUAUGAUAAAGGUAUGUUAAGUCAAAAAUUAUUUUCUACCUUCUAUUUUCAGUCUUUCAGCCAGCUCUCUACAUUUAGUAUACUUCUUCAAGGGCUCUGGAACAGCCUUGGCUAAUGAAUCCAUGUCAACUUCCUCAUACUUCAGAACAUCGAGAGCUCUGCAAAUAUAUGAAAGUUUCAUUAACAUAAGGAUCCAUGUCAUAUAAGGCAGAUCAAGAACAAGAUUCUUUGAAAUAAUAUCAGAUCUCAGAAUAAAUACCAAAAGAUUAUUUCUUUUUUUUUUUUUUUGAGAUGGAGUCUCGCUCUGUCGCCCAUCAACUGUAGUGCAGUGGUACAAUCUUGGCUCACUGCAAUCCCCACCUGCUGGGUUCAAGCAAUUCUCCUGCCUCAGACUCCCUAGUAGCUGGGACUACAGGCAUGCGCCACCAUGCCCGGCUAUUUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCAUGCUGGCCAGGCUGGUCUCGAACUCCUGACCUCGUGAUCUGCUAAACUGCUGGGAUUACAGGCAUAAGCCACUGCGCCCGGCCCCAAAAGAUUAUUUCUAAGUAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-176.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -190.00

Frequency: 0.0000

Diversity: 178.01

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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