Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_RP11-530C5.1_0000900

Sequence Length

459 nt

GC Content

0.3856

UGGUGCGAAUAAAGAGCCGAAUAACUUAUGUACUACUCUACAUGUGAUAGGACAAAACUAAGAAAAUUUUAAUAGGCUGGAAAAGACAGGGUCUCACUUUGUCACCCAGGCUGAAGUGCAGUGGUGGGAUCACAGCUCACUGCAGCCUCAACCUCCCAGAUGUCAUCAUGUGGAGAAUGAUGUGCCAUUAUUUAGUAUAACACAGAGAAAGAAAAAGAUACCAACACUGCCAAUUAAGUAGACAUACCAUCACAUAUAAGAUGAACUUCAACUUCAGAGAUAUCAAAAUGUGAAAAAUAUGUCCUUCUUAAAAGUUAUGAGGUGUUAAGAUUUGGGUUUUAGACCCUCUUCUGGCUCACUAAAACCUGGAUUCAGGAAGAAAGAGAAGCACCAGAUAUAGACAGUUCACAAAUUGGAUAUUCUUCUUUCUAGAGCUCUUCGUUCCUAGAUCGAUUUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-104.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -114.07

Frequency: 0.0000

Diversity: 113.16

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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