Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_RP11-96D1.11_0000300

Sequence Length

640 nt

GC Content

0.4797

CAUACUGCAAACUUCAGAGGCUCUGUAAUGGGCCCAGGAACAGGUAAAAAAAAUCCCAUUAGGGAGAGGGGUAAGGGCAGGUUUUUUUUUUUUUUAAAGUACCCAACUCGGGUACCUCCUUUGGUAGACAGCAGGCUGCAGUUUCUGCUGGGCCCUGCCUUGGACACCAGUCUCACCAGCAGCAGCACCAGGGUGUCUUUGGUGUGGAGGGUCAGGUUAUCACUUCUGGAUGUGCUCAGAGCCUUCUGGGGAAAAGGCUGGUUUUUAGAUCAUACAGACAGGACAGGGUAGGCCAGAAUCAUUUCAGGCUAUAAAUAGAAUGGCAGAUAAGCCUUCCAUGCCAGUGUGACUCUUAAAACCUUCCCAUCUGGAGUCCUGUAUUUUCUCUGCCCAUGCUGAUGUACUGCUCAUUUGUGCUUUAGCUCUGCACACAGCCUGGCCUCUAGCUAGAGUUAGAACUGCAAAGCUGCCUAAACCACUGAGACUGGCUUCAAAGGUCACAGAACAGCCAAAGGCAGAUGCUUCUGUUUGGAAAAGGUUCUACGACCAGAUGACACAAACAGGAAGCGCACUCCACAGCCUACUAGUUUUUAUGAUGGCAAGAAAUGAAAGUGACCAAGCUAGAACCCCACCAUUCAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-193.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -205.12

Frequency: 0.0000

Diversity: 117.53

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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