Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_RP5-1101C3.1_0000300

Sequence Length

736 nt

GC Content

0.3655

ACUUCCAGGCAGGUUCCUAAACAUGCCUUAUCCCCAAUGUUUUUCUCUGUUUUCAUAACUUCCAUUUUUUGAAUUCAAAGUGAUCAAAUGUCAUCAGAAAGCUAUUGUAUAUAAAAUACAGAGCUUCUACAUGUUAAACUUUUGGGUUGAAUUGAUUCUGGCAAAUCUUAAAAUCAAGGGACGAGCCACAAAAGAGGUCAUUGAUACCCAUUUUCUUGAAAAGCAGUGAAAGUCAGUGGACACUAGGAACCAUUAAAUUCUCCUAUAAUACACUCCCGUAGAUUGUUGCUUGCUUUGAUACCUGAUCUAGCCAUAAGCAGAGACAAAGAGAAAAAGAGGAAGAGAUGGGGAGGGAGGGAGAGAAAAUGAGAAUGAAUGAACAAAAACAAACACAUACAAUGUUAAAAACAAAGGAAUAAAGAAGUAUACAUCUGAAAUUUAAUACCCAAGGGGUAAAUCCAAAUAGUGUGAGGUUUUUAGAUUUGCAUAAUAUGGGAUUCUGCUAUUGUAAAUGUAUCUGGUUAGAUAUGACUUACACUAAUAUUACAACUGCUGGGAACUUUCAGAAUCUGCUCUGGCUGUGCAGUUGGUGGAGGUCGUAUAGGCACAUGAGUGUGAGAGAAAAGAUGGCCCGAGAAUUCCCAUUUUACAUAUAUAUUCUGCAGACAAUAACUCACAUAUGCCAUACAUAGGUAUACAAAAUUAGCUAGAAAAAGUCAUUCAUUAGGGGACCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-155.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -172.91

Frequency: 0.0000

Diversity: 197.74

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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