Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RP5-977B1.7_0000100
Sequence Length
374 nt
GC Content
0.5856
GUGGUAGAGUUCAUCGAACUUCAUGCUGAUAUCCUCGAUGGACAGCUGUAGCAGGUCCCAGAACCCUGCCAGGUCCUGGGCUGUGGGGCGUGGGUUGGCAUCAGGGUUCAAGUUUUGCUCACAGAGGCCCCGGAACUGCUGGAAUUUCUGGGACAUCAGUAGCUGGGCACUGCCCACAGCACUGAGGACUUUUCCUAAGACUUCUUCAGAGAGGUUGUUCUCUUUGGUCUCCUUGUCCAUCUGGCAGCACCAGCCUUCCAGCCGCUCUGUUUCUGCCUGCAGUAGCUUUAGGAACCAGUAGCCGUCUCGGCGGCAGGCCCCUGGCUGUGCCGGCUCUGCUGGGGAGCUGGAGGAGGUCUCGAGCCAGGGGUCGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-152.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -159.14
Frequency: 0.0000
Diversity: 47.20
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.((((((...))))))...((((....((..((((((((((((...)))(((((((((.((.((.((.(((.(((((.(((((((.((.(((((......).)))).)).))))).))..))))).))).)))).))...)))))))))..((((.(((((((...))))..)))))))((((....)))).((((.....((((((((....))))))))))))..))))))))).)))))))))).((((((....(((((((........)))).)))....))))......(((((....))))).(((((((((((..(((..(((((((....))).))))..)))....)))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((.((((((...))))))...((((....((..(((((((((({{...)}}(((((((((.((.({{((.{((.(((((.(((((((.((.(((((......),}))).)).))))).)).,))))).))}.)))).))...)))))))))..((((.(((((((...)))),.})))))){(((....)))}.((((.....((((((((....))))))))))))..,)))))))).)))))))))).(({(((....(((((((........)))).)))....))))......(((((....))))).(((((((((((,.(((..(((((((....))).))))..))}..,.)))))))))))))
Back