Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_RP5-977B1.7_0000400

Sequence Length

2458 nt

GC Content

0.4459

CUUAACAGUGGAUGUAACUGCUUCUUUGCUGUGGCAGAUUGUAUUUUCUGAAGGCCCCAACAGUCUCUCCUGUCCCUCCUCCUCUUCUGAAACCUUGAUACUUCCCUAUGAAGAGGUAGGGUCUAAUACUUCCCUCCUUCAACCUGAAGCCCCGCCUUGGGCUUGUGACUUGCUUGUAACCAGUCAAAUACAGUGGAAGAGUUACUACGUGACUUCCAGGGCUAGGUCAGAAAAGGAUGCAGCCUCAGGGUUCAACACACACUUGGGCCUGGAGCCACCAUGCAAGAAGGCUGCCAUGCUGCGAGGGAGCAAAGGCACGUGGAGGGACAUACACAGGGGCUGUGGCUGGCAGUCCUGGCCUUUGAGUCAUCCUUGUUUAAGUGCCAGGCACACACGUUAACUACCUUUAGGUAAUUCCAUACCUCAGGUGUCAUGUCACCCCAAGCCCUUGAGCCUUCCCAUCUGAAGCCCCAGGCUGUAUGGAGAAGAAACAAGAUGUUCCUGCCACGCUCUUUCUGAACUGCUGACAUACAGAAUCUGUGACCAUAAUAAAAUGGUUGUUUUGUGCCAUUAGGUUUGGCGUGACUUGUUAUGCCCUUCCUGCUUCUGUGUCUUUGCUCCCUCCAUCUGGAAUGCCUUUCCUCUCCCCCAGCCUGUAGAUAUUCUCUGAGGCCCAGCUACGAAUGGUAUCUCCUUGGUGGAGUUCCUCACAGAUUUAAGAGGGGUGACCUUAAAACUUGUGGCCACGGCUGGGUGUGGUGGCUCACACCUGUAAUCCCAGCAUUUUGGGAGGGCGAGGUGGGCAGAUCACUUGAGGUCAGGAGUUCAAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCUGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUUAGCUGGACGUGGUGGCAUGUGCCUGUAAUCCCAGCUACUCAGGAGGCUGAGGCACGAGAAUCACUUGCACCCAGGAGGCGGAGGUUGUGGUGAGCCGAAAUUGUACCACUGCACUCCAGCCUGGGCAACAGAGUGCGACUCUGUCUCACAAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAAAAAAACAACUUUUGUGCCCACAAGUCAGGGCCUUGAGUGGAUGUACAGAAUUUAAUCAGAGAGCCUUGCAAUUUCAAUGAAGAGUAUCAUUCUUAAGAGACAGGAAACAUUAUUCACAACGGCCAAAAGGUAGAUGCAAUCCACCUAUCCAUUGGCAAAUGAAUAGAUACAUAAAAUGUAGUCUCUACAUACAAUAGAAUAUUACUCAGCCUUAACAAGGGAGGGAAUUGUGACACAUGCUAUGGAUGAACCUUGAAGACAUUAUGCAAAGUGAAAUACGCCAGUCACAGAAGAACAAAUGCUGCAUGGUUCCACUUACAUGAAGUAGCUAGAAUAGUCAAACUCAUAGAGACAAAGUAGAGUGGUGGCUGCCAGUGGCUGGGGGUAGGAGGGAAUGGGGAGUUAGUGUUUAAUGGGUACAGAAUUUCAGCUGGGGAAGACAAAACAAGUUCUAGAGAUGGACGGUGGUGAUGGUUAUACAACAGUGUGAAUUUAAUGCCACAGACUGUAAACUUGGUUGAAAUGGUAAUUUUCAUGUUAUAUAUAUUUAACCACAAUUCAGAAAAAUAAAUUAUCUGAAAAGAACAUUGUCAAGUUUAAAGUUCUUCAGGUUUAGACAAGAGGGCAAUGCAAAAUUCAGUCAAUACAGGCAGCCACCUGGGUGGGUGGGCACUGCUGAGUUCCCUGACCUAUGUAUUUUGGAUAAGGGACAUGAGCUAUGUGACUCCAUCUGUCUGUAAGUUACAGUAACUGAUACAGGGCUAUGAAAAGGGCCCCCUCUAGAGUUCAUGUUCAACUGCAGGAGUUCUGGUGUGGUUAUCCAGAAACAUCAUAAAAGACCUCUUCCCUCCCAGGUAGACAGGAAGGUAAUACCAAUAUCGUUUGGUAUGACAUAAUUUCCUUUGCAGGCAAACAUCUUCUUGCUCUAGAAAUAACUAGAAUUAAGUAUAGUAAAGGAAAGUUAAAGGGAAUCAAAUCCACAGAAUCACCCUAUUGGCAUGAAGCAAUCUGUGCACCCUGCCCCAGGCUUACUGUCUCAAUCUGUGCUCAAUACAGCAGCUACUAGCCACAUGUCGUUAGUAAGCACCUGAAAUGUUGCUUGUCUGAAUUAAGAUGUGCUGUAAGAGUAAAAUAUACACUAAGUUUUAAAGACUUACUAUGAAAAGGAAUAUAAGAUAUUGCAAUAGUUUUAUAUUGAAUAUAUGGUGAAAUACAGCUGACCCUUGAACAACACAGGUUUGCACUGCAAAGAUCUACUUAUGUAUCAAUUUUCUUCCCAUCUGCCACCCCUGAGACAGCAGGACCAACAUUCCUCCUCUUCCCCAUUCCUCUUCCUCAGUGUACUCAAUGUGGAGACAAGGAGGAAGACCUUUAUGACGAUCCACUUCUGCUUAAUGAACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-746.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -790.24

Frequency: 0.0000

Diversity: 703.36

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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