Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_RP5-977B1.7_0001000

Sequence Length

618 nt

GC Content

0.3916

GUCAAGGCUGCAGUGAGCUAUGAUGGCACUAUUGUUAAUUUCAGCCUGGGCAGCAGAGUGAAACCCUGUCUCCAGAACAAACAAACAAACAAACAAACCCCAAAAGCUAUCAAGAAAAGUGGAAGCAAGUGUUGCAAAGAUGUGGAGAGAUUGGAACCCUGUGCAUUACUGGUAGGAAUAUAAAAUGAUGCAGCUGCUGUGGAAAAUAGUUGGGUGGUUCCUCAGAAAGCGAGACAUAGAUCUGCCACAUGAUCAACCAAUUCCACUUCUGGGUAUAAACCCAAAAGAAUUGAAAACAGACUUAAACAGAUACUUGUACGCCAAUAUUUAUAGCAGUUUGACUCACAGUAGCCAAAAGGUAGAAACAACCCAAGUGUCUGUCAAUAGAUGAAUAGACUCUGACUAAAAAGAAAAUCUGUGUGUACAUGCACGCACGCACACGCACGCACACAGACAGAAAACUCUAAACCUCAUAUAAAAUAUACUUCUCACACAUGGAACAUUUGCUAAAAAUGACCACAUUCUUGGCCAUAAAAUAUACAAUAAAUUAAAUUACAAAGAACUGACUGGGUAUCAUACAGAUCAUGUGUUUUGUUUUUGAGAUAGGGUCUCUGUCUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-149.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -161.33

Frequency: 0.0000

Diversity: 93.78

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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