Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SETDB1_0001900
Sequence Length
256 nt
GC Content
0.4648
GACUUCUACUCCAAGCUGGGACUACAAUACCGGGACAGUAGCUCUGAGGACGAAUCUUCCCGGCCUACAGAAAUAAUUGAGAUUCCUGAUGAAGAUGAUGAUGUCCUCAGUAUUGAUUCAGGUGAUGCUGGGAGCAGAACUCCAAAAGACCAGAAGCUCCGUGAAGCUAUGGCUGCCUUAAGAAAGUCAGCUCAAGAUGUUCAGAAGUUCAUGGAUGCUGUCAACAAGAAGAGCAGUUCCCAGGAUCUGCAUAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-62.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -67.77
Frequency: 0.0001
Diversity: 29.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((.((((.(((...........((((.((((((((...(((((((((.((((((..((.((.((........))))...))....)))))).....)))))))))))))).))).))))..))).)))).)))).))(....(((....(((((((((((....((((((.(((....))).))))..........))....)))))))).))))))..........((((.((....)).)))).....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.((((.((((.(((,{......},.((((.((((((((...(((((((({.((((((.,((.{(.((,......,))})...}),)..)))))).....}))))))))))))).))).))))..))).)))).)))).))(....(((....(((((((((((,((.{(((((.(((....))).))))}.............}})))))))).))))))..........((((.((....)).)))).....)
Back