Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_SETDB1_0003300

Sequence Length

1827 nt

GC Content

0.5178

GGCCAGGGAAGAAAUACAAGGUGAAAUUUGACAACAAAGGAAAGAGUCUACUGUCGGGGAACCAUAUUGCCUAUGAUUACCACCCUCCUGCUGACAAGCUGUAUGUGGGCAGUCGGGUGGUCGCCAAAUACAAAGAUGGGAAUCAGGUCUGGCUCUAUGCUGGCAUUGUAGCUGAGACACCAAACGUCAAAAACAAGCUCAGGUUUCUCAUUUUCUUUGAUGAUGGCUAUGCUUCCUAUGUCACACAGUCGGAACUGUAUCCCAUUUGCCGGCCACUGAAAAAGACUUGGGAGGACAUAGAAGACAUCUCCUGCCGUGACUUCAUAGAGGAGUAUGUCACUGCCUACCCCAACCGCCCCAUGGUACUGCUCAAGAGUGGCCAGCUUAUCAAGACUGAGUGGGAAGGCACGUGGUGGAAGUCCCGAGUUGAGGAGGUGGAUGGCAGCCUAGUCAGGAUCCUCUUCCUGGAUGACAAAAGAUGUGAGUGGAUCUAUCGAGGCUCUACACGGCUGGAGCCCAUGUUCAGCAUGAAAACAUCCUCAGCCUCUGCACUGGAGAAGAAGCAAGGACAGCUCAGGACACGUCCAAAUAUGGGUGCUGUGAGGAGCAAAGGCCCUGUUGUCCAGUACACACAGGAUCUGACCGGUACUGGAACCCAGUUCAAGCCAGUGGAACCCCCACAGCCUACAGCUCCACCUGCCCCACCUUUCCCACCUGCUCCACCUCUAUCCCCCCAAGCAGGUGACAGUGACUUGGAAAGCCAGCUUGCCCAGUCACGGAAGCAGGUAGCCAAAAAGAGCACGUCCUUUCGACCAGGAUCUGUGGGCUCUGGUCAUUCCUCCCCUACAUCUCCUGCACUCAGUGAAAAUGUCUCUGGUGGGAAACCUGGGAUCAACCAGACAUAUAGAUCACCUUUAGGCUCCACAGCCUCUGCCCCAGCACCCUCAGCACUCCCGGCCCCUCCAGCACCCCCAGUCUUCCAUGGCAUGCUGGAGCGGGCCCCAGCAGAGCCCUCCUACCGUGCUCCCAUGGAGAAGCUUUUCUACUUACCUCAUGUCUGCAGCUAUACCUGUCUGUCUCGAGUCAGACCUAUGAGGAAUGAGCAGUACCGGGGCAAGAACCCUCUGCUGGUCCCGUUACUAUAUGACUUCCGGCGGAUGACAGCCCGGCGUCGAGUUAACCGCAAGAUGGGCUUUCAUGUUAUCUAUAAGACACCUUGUGGUCUCUGCCUUCGGACAAUGCAGGAGAUAGAACGCUACCUUUUCGAGACUGGCUGUGACUUCCUCUUCCUGGAGAUGUUCUGUUUGGAUCCAUAUGUUCUUGUGGACCGAAAGUUUCAGCCCUAUAAGCCUUUUUACUAUAUUUUGGACAUCACUUAUGGGAAGGAAGAUGUUCCCCUAUCCUGUGUCAAUGAGAUUGACACAACCCCUCCACCCCAGGUGGCCUACAGCAAGGAACGUAUCCCGGGCAAGGGUGUUUUCAUUAACACAGGCCCUGAAUUUCUGGUUGGCUGUGACUGCAAGGAUGGGUGUCGGGACAAGUCCAAGUGUGCCUGCCAUCAACUAACUAUCCAGGCUACAGCCUGUACCCCAGGAGGCCAAAUCAACCCUAACUCUGGCUACCAGUACAAGAGACUAGAAGAGUGUCUACCCACAGGGGUAUAUGAGUGUAACAAACGCUGCAAAUGUGACCCAAACAUGUGCACAAACCGGUUGGUGCAACAUGGACUACAAGUUCGGCUACAGCUAUUCAAGACACAGAACAAGGGCUGGGGUAUCCGCUGCUUGGAUGACAUUGCCAAAGGCUCUUUUGUUUGUAUUUAUGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-607.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -637.17

Frequency: 0.0000

Diversity: 485.96

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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