Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_SETDB1_0006100

Sequence Length

1628 nt

GC Content

0.4226

AGAUGGGGUGGACUUGCUUUGUCAUUCAGGCUGGAGCGCAGUGGUAUGAUCAUAGCUCACUGAAACCUCGAACUCCUGAGCUCAAGUGAUCUUCUCACCUCAGCAUCCUCAGUAGCUGGGAUUACAGGCAUGAGCCACUGCGCCUGGCCCAAAUUCUUAAAUUAGAUAGAAUAUGAGCUCCCCUGGGCUGGGCACGGUGGCUCACACCUGUACUCCCAGCCCUUUGGUUCGCUAAGGCAGGCGGAUCACAUGAGGUCGGGAAUUCGAGACCAGCCUGAUCAACAUGGAUAAACUCCAUCUCUACUAAAAAUACAAAAUUAGCAAGGCACGGUGGCGCGUGCCUGUAAUCUCAGCUACUUGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCACUUGAACACGGGAGGUGGAGGUUGUGAGCUGAGAUUGCGCCAUUGCACUCCAGCCUGGGCAAUGAGAGCGAAACUCUGUCUCCAAAAAAAAAAAAAAGAGCUCCCUGAGGGUAGAAAUUAUGACCUUUUUUUUUUUCUUUUUUUUCUUUUUUCUUUUUUUUUUUUUUUGUGACAGAGUCUCACCCUGUCGCCCAGAUUGGAGUGCAGUGGCUUGAUUUUGGCUCACUGCAACCUCCGCCUCCUGGGUUCAAGGAAUUCUCCUACCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGACUACAGAUGCAUGCCACCACACCCGGCUAAUUUUUUAAUUUUUAUUAGAGACGGGGUUUUACUGUGUUAGCCAGGAUGGUCUCACUCUCCUGACCUCGUGAUCCACCCACCUUGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUAUAGGCAUGAGCCACCACGCCCAGCACGAUCUUUUUCAUUGUUAUGUUUCCAGUGUUUAGUAGAGCUCUUGGUGUUUAAUAAUUGUUUACUGAAUGAAAGAAUGAAAAUCAACUUUACCAUGAACAUUAGUCACAGUUCCUCCUAUCUCUUUAUUCCCUUUCGUAUCUGUUAUGUUGGCCUCUGUUUUUCUCACAUUUAUUUAUUUUUAUUAUUAUUAUUAUUUUUGCUGUUGUUAGUAAGAAACCUCACCAGGAAUUUCUCACAUGUCUUUAUUUUGUGCAUCUAUUUCUACAAAUUGACCGUCCAUAUAGUGCUUAUUUUAAUGGCUCUGUAAUCUGUAUUCCCAUUAUAGUUUACUUAGCUUUUCUCCAGGUGUUAGGCACUCUAGCAUUCACUUUUAUGAGCUGUCUUGCUAUAGACAUCUUUAUAAAUAUUUCUCCGCCCUCUAAAUUUUUUCCUUGGGCUACAUUUCCAAAUGAAUCAAAGAGCAUAGAUGGUUCAAUAGAUCCACUCACUUAGAUCAUUACCUAAUUUUUAAUCUUUAUCCACAACACAUUAUAAAUGAUGAUAGCUUAAGAAUUAUAAUAGUUUUAUGGAUUUUUUUGUGCUCUAGUGAUCAUACCGUGAUUGAUUUUAUUCUAACCUCCUCCCAGGGUAUAUGAGUGUAACAAACGCUGCAAAUGUGACCCAAACAUGUGCACAAACCGGUUGGUGCAACAUGGACUACAAGUUCGGCUACAGCUAUUCAAGACACAGAACAAGGGCUGGGGUAUCCGCUGCUUGGAUGACAUUGCCAAAGGCUCUUUUGUUUGUAUUUAUGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-612.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -638.10

Frequency: 0.0000

Diversity: 240.70

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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