Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_SHKBP1_0001700

Sequence Length

492 nt

GC Content

0.6057

GGGUCUUUCAUCUGGGGGUGCCUGUGGAGGCCUUGUUCUUCGUCGGGAACCAGCUCAUUGCUACAAGCCACACAGGGCGCAUCGGGGUGUGGAAUGCCGUCACCAAGCACUGGCAGGUCCAGGAGGUGCAGCCCAUCACCAGUUAUGACGCGGCAGGCUCCUUCCUCCUCCUGGGCUGCAACAACGGCUCCAUUUACUACGUGGAUGUGCAGAAGUUCCCCUUGCGCAUGAAAGACAACGACCUCCUUGUCAGCGAGCUCUAUCGGGACCCAGCGGAGGAUGGGGUCACCGCCCUCAGUGUCUACCUCACCCCCAAGACCAGUGACAGUGGGAACUGGAUCGAGAUCGCCUAUGGCACCAGCUCAGGGGGCGUGCGGGUCAUCGUGCAGCACCCGGAGACUGUGGGCUCGGGGCCUCAGCUCUUCCAGACCUUCACUGUGCACCGCAGCCCUGUCACCAAGAUCAUGCUGUCGGAGAAGCACCUCAUCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-178.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -189.73

Frequency: 0.0000

Diversity: 112.51

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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