Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SHKBP1_0002900
Sequence Length
201 nt
GC Content
0.6269
GCCCUCUCCUCAUCCUUGGCCCCUCACCAGGUGACAGUGGGAACUGGAUCGAGAUCGCCUAUGGCACCAGCUCAGGGGGCGUGCGGGUCAUCGUGCAGCACCCGGAGACUGUGGGCUCGGGGCCUCAGCUCUUCCAGACCUUCACUGUGCACCGCAGCCCUGUCACCAAGAUCAUGCUGUCGGAGAAGCACCUCAUCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-67.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -71.14
Frequency: 0.0023
Diversity: 21.30
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..((((((.......(((.......)))((((((((((((..(((((..(((...((((..(((.(((((((.(((.((((((((....)))))).)).))).))).))).).)))..)))).....))).)))))...)))))))).))))(((((...(((.....)))...))))).)))).))..)((......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..((((((.......(((.......)))((((((((((((..(((((..(((...((((..(((.(((((((.(((.(({((((,,...,)}))),)).))).))).))).).)),..)))).....))).)))))..}}})))))).))))(((((...(((.....)))...))))).))))},)..)((......))
Back