Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_SHPRH_0004000

Sequence Length

1231 nt

GC Content

0.3566

GUAGGUAAUAAUUUACCACAAGUAGAAGGGGGAAGGUUUUCCUGUUAAAAGUUUGUAUCUUUAGAACUUCUUCACUUAGAUGACAACGAAAAAUAUAGCACAAAUACGUUUUUAAAAGCAAAGUCUGACGUUUUGCCUUUUCACUGUUUCCCAGUCAGUGCUCCAGACUUUGUAUAUUUGAAUUAAUUUAUUAAUUGUAACAUGUAAAUAUAAACUAUACUACAUUCCUUUGCCACAUUGGAUCACUUUCUGAGGCUGGGAGUUCGAAACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCCAUCUCUACUAAAAACACAAAAAUUAGCCAGGCAUGGUGACACGCACCAUAGUCUUAGCUAGUCGGGAGGCUGAAGCAGGAGAAUCGCUUGAACCCCGGAGGUGGAGGUUGCAGUGAGCCAAGAUCGUGCCACUGCACUCCAGCCUGGGCAACAGAACGAGUCUGUGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAACUUGUUAAGGUUAAUUGUGGUGUCAAUCCAAAGACAAAACAAAAGCAGAGAGACUAAACCAGUCUUAAUUUUAAAAGCUUGACUCUGGAAUCAUAGAACUUUCUAAUAUUUAUGGUAUAAUUUAUUUAAAUCUUUUUGAAAACAUAAAUCUUUCUACAUCUUUAGGAGGUAGGUAGGAUUGGAUGGUACCCAAGGAAGAGAUUAUUGCCUUAGAAGGGAUUGUCACAUAGCAAAGAAGCAAUUUGAAACUAGAAAUUUUCUUCCAUUGAUGGUUUCUGGGAAGGAAAGAGGCUUCCACAAGGGCCUUUUUACCUAAAACAUGAAGGCUUUUUAAAGUUCUUGUUUUCCUUGUGUAUCAGACUUCAGUGAUUUUUAUUUAGGUUGUUUUAAUAAAAUAGCAGUUAUGAGUUGUUUGAAAUUCUCUUGAAACAAAUUAACUUCAGGUGGUAAGAAGGUAAUUUGUAAGGUGAGAGCCUUAGUAGCAGUAGUCAAGAGUUUUAUUCUUUGUUCUAUUAAUUGCACAGAGAAAAAACACUUUGACAAACACUAAAAGUAAUAUAUAGAAAUCUUCACUUUGACAAGGUAUAACAAAGAUUUUAUCACUUGCUUUCCUCUGGGAGUUUCUUAUAUCCCAAUUACAAAAACUUAAGAAAAAAUAUGUGUCUAGUUCGUAUUACUACAAAUAUAAUCGCUGAUGGCUUGGGGUUUCUUUCUGACUGUGCUCAUUUGGGAAACCUUGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-298.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -320.79

Frequency: 0.0000

Diversity: 323.58

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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