Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SHPRH_0011300
Sequence Length
379 nt
GC Content
0.4749
AUCCAAAUACCACCACAAACCGAAGAAAUACACUGGCUCCACUUUUCUCCAGUGGAAAGGCAUUUCUAUCACCGUCAGCAUGAGGUGUGCUGCCAGGAUGUGGUGGUAAAACUCAGGAAGAUUUCUGACUGGGCUCUGAAGCUCAGCAGCCUAGACAGAAGGACUGUCACCUCUAUCCUGUAUCCAUUGCUGAGGCUCAGACAGGCCUGCUGUCACCCACAGGCUGUUCGUGGAGAGUUCUUGCCACUCCAAAAAAGCACCAUGACAAUGGAAGAGCUGCUGACAUCUUUGCAGAAGAAAUGUGGAACUGAAUGUGAAGAAGCACAUCGACAGCUAGUUUGUGCUCUCAAUGGCUUAGCAGGCAUUCAUAUUAUUAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-111.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -117.45
Frequency: 0.0001
Diversity: 90.28
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......((((((((((....((((((((.(.((...((((((.......)))))).))).)))))).)).((..((((((.....))))))...)).))))))))))....((((((....)))))).((((((((((...)))).))))))(((((.(((.(((((.((((..................))))....))))).))).)))))..(((((.(((.....(((((.((....))..)))))....))).((((....)))).....((((..........))))......)))))...(((((((....((((.(((.((.(((........))).)).))))))).....)))))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{{{,..((((((((((..,.{,((((((.,.((...((((((.......)))))).})}.)))))).}}.{{,.((((((,...,)))))),}.)).))))))))))....{(((((,{,.|||||,{((((((((((...)))).))))))|{|||,|{{.{{{{{.{{||,.,,,}|..,{{{{{{,{|}}|{{..|||||,|||{,||,,..,||||}|||,,}..(((((.((....))..)))))....))).{||,,.,,)))),....(({(,{........))))......,,)))}.,(((((((....((((.(((.((.(((........))).)).))))))).....)))))))..........,
Back