Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SLC12A9_0000200
Sequence Length
787 nt
GC Content
0.6811
GUGCAGGGAUAGCAGGGCCAUGCAGGCACCCUGGUCCUGGAAGGCCAGGUAGAAGCCAGCCUUGCUGAGCGGUCCCAGACGCAGCGUCUUGACAUUCACCUUCCCGGUGGCCUCGGCCCCAGGGCGCUUCCGGGUGAGAUGCUCCGCGGCCACCGUGUCCACCUUGAUGUAGGGGUUCUCCAUCCAGGCUGGCGUGAGGGCCGUGGCCGUGUCCGCAUCGCUCUCAUAGUAGAAGACGGUGAAGGUCUCCUUGCAGGAGCGCCCAGCCCGAGGCAGGGACAGGCACUCGAGCAUGGUGAAGCGCAGCGUGGCGUACACGUGGACGGCGCCCCGCCGUGGGACCCAACCUGUGCGAAGCCAGUGGGCCUGGCCCGGGGCACGCUGCACGUCACACACUUCGUAGGUGCGCACGCUGUGCUGUUCCUCAUCCAGGCCGCUCAGUUCCUCCCACUGCCCGUCCACCUGAGGGAAUGUCACCCACUUCAGAUCAGCAGUUUCCAAUUUUGUGUUCAGCAGGGUCUCUUCCAAAGCUGCGGCCAACGAAGCCCAGCAGAGCAGCACCCGGAGCUCCAUGGCGCCGCCUCACUCGGGUAGGAUCCGAACUGAGUUUGGGGGGCCCUCGCCCCCCCAGGUCUGACUCUCCCUGGGCGGGUGGACGCCGAUACUCCGCGCGGGACUCCUCGUCGGGGCCCUCAGCGCGGGCCCAUGCGAGCGUGCGGGGCACCGGGCGGCGGCGCCAAGUGUGGCCCCGCGUCUGUGCCGCGCGCGCGGGCGGCGGGCCCGGAGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-375.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -389.15
Frequency: 0.0000
Diversity: 212.93
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((.((.(((((((((.(((..(((((((......)))))))..((((...((((((((((((((((..(((((...))))).)))...((((.....))))(((((((.(...(((((((((.(((((((((((.((((((((..((((.((((((.((((.((.....)).)))).))).)))))))..))))))))..)))))....)))))).....((((.((((.......)))).).))).))))))))).).))))))).((((..((.(((.((((.(((((((((((((((((.(((((..(((((((((((((((((..(((.((((..(((.((...)))))))))))))))..))))).....)).)))).))).((....)))))))))))))))))).....))).)))....))))))).))))))(((((..(((....(((((............))))))))..)))))...........)))))))))))))..))))....((((.(((.......)))))))...((.((.(((((.(((((..(((((((((.(.((((((.(((.((.((.(((.....(((((((....)))))))))).)).)).))).)))))).)))))).))))........(((((......(((((..((((((.......))))))..))))))))))))))).)))))..)).)))))..))))))))).)))))).)).)))((.(.(((((.....)))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({(,(({,.((.((((({({(.(({..{{{{{{(||,...)))))))..((((...(((((((((((({(((..(((((...))))).}}}...((((.....))))(((((((.,...((((((((({((({(((((((.((((((((..((((.((((((.((((.((,...,)).)))).))).)))))))..))))))))..))}}},.{{||||||{,...,,{|.||||}}}}..,))))}))))}.))))))))).).))))))).((({.,((.(((.((((.((((((((((((((((,{((((({(((({((((((((((({{..(((.((((..(((.((...))))))))))))))}.,))))).,..,}),)))}.}}}........,)))))))))))))))).....))).)}}....))))))).)))))){((((..{{{...|{{|((|........,,.,,}}})))..)))))...........}))))))))))))..))))....((((.(((.......))))))).((((..(....|..)))}..{(((((((((.{.((((((.{({.((.({.(((.....(((((((....)))))))))).}).)).})).)))))).)))))).)))),...{{((({((({{....|||||}}||||||},.||.{||||||.{||,,|||||||}|||,|}|||||}|||}||||.}}}))))}),))))))}))))})||}|,|{{||,..,,))))),.))
Back