Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SLC24A2_0000300
Sequence Length
456 nt
GC Content
0.5132
UCAUCGAGGAAGUUUUUUCCCAUCACGUUCUUUGGCUCCAUUACCUGGAUUGCAGUAUUCUCUUACUUGAUGGUCUGGUGGGCGCACCAGGUUGGAGAGACAAUUGGCAUCAGUGAAGAGAUUAUGGGCCUGACCAUCUUGGCUGCUGGGACCUCCAUCCCUGAUCUUAUCACCAGUGUCAUAGUGGCCCGGAAGGGGUUAGGGGACAUGGCUGUGUCCAGCUCUGUUGGAAGCAACAUUUUUGACAUCACUGUAGGGCUCCCACUGCCCUGGCUCCUGUACACCGUCAUUCACAGAUUCCAGCCAGUGGCUGUCAGCAGCAAUGGCCUUUUCUGUGCCAUCGUCCUUCUCUUCAUCAUGCUGCUCUUCGUCAUCCUCUCUAUCGCCCUCUGCAAGUGGCGAAUGAACAAAAUCCUGGGCUUCAUCAUGUUUGGCCUCUACUUUGUGUUCCUGGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-136.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -145.64
Frequency: 0.0000
Diversity: 115.77
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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