Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SLC24A2_0000900
Sequence Length
440 nt
GC Content
0.4864
GGAGGUUCAGAGAAAAGGCUUCAAUUCUCCACAAGAUCGCCAAGAAGAAAUGUCAUGUGGAUGAGAACGAGAGGCAGAAUGGGGCUGCCAACCACGUGGAAAAAAUUGAGCUUCCAAACAGCACCAGCACAGAUGUUGAAAUGACACCAUCCAGUGAUGCUUCAGAACCUGUACAAAAUGGAAAUCUCUCCCACAACAUUGAAGGUGCAGAAGCCCAGACCGCUGAUGAGGAGGAGGACCAGCCUCUCAGCCUUGCCUGGCCUUCUGAAACCCGCAAGCAAGUCACGUUUCUGAUUGUUUUCCCCAUAGUGUUUCCUCUCUGGAUUACGUUACCUGACGUUCGCAAACCUUCAUCGAGGAAGUUUUUUCCCAUCACGUUCUUUGGCUCCAUUACCUGGAUUGCAGUAUUCUCUUACUUGAUGGUCUGGUGGGCGCACCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-114.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -124.42
Frequency: 0.0000
Diversity: 80.96
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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