Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SLC24A2_0004100
Sequence Length
1083 nt
GC Content
0.4303
CAUAAAUGAUGAAAGUUUCCUGUGAAGCAUAACAAUCCCUGAUUGUGAAAGUACCCCACAAGCAUCGUUAACUAUAAAGUAAGGAAAAGUAUGAAAGAACCAUCUGGUUGAGUCUAAAGUUGGAAGAUCACCAUAUCCACCAGAAGACCCAGGAUGGAUCUGCAACAAAGCACCACCAUCACUUCCCUAGAGAAAUGGUGUUUGGAUGAGUCACUGUCUGGCUGCAGAAGACAUUAUAGUGUCAAGAAAAAACUGAAGUUAAUUCGAGUCUUAGGCCUUUUCAUGGGUCUGGUAGCCAUUAGCACUGUCUCAUUUUCAAUCAGUGCCUUUUCUGAGACAGAUACACAGAGCACAGGAGAGGCCAGUGUUGUAAGUGGCCCUAGGGUAGCACAGGGUUACCAUCAGAGAACUCUCUUAGAUUUAAAUGACAAGAUUCUGGAUUAUACUCCACAGCCACCUCUUUCUAAGGAAGGCGAGUCUGAGAAUAGUACAGAUCACGCCCAAGGAGACUACCCGAAAGACAUCUUUUCCCUUGAGGAGAGAAGAAAAGGUGCGAUCAUUCUGCAUGUCAUUGGAAUGAUCUACAUGUUCAUAGCCUUAGCCAUUGUCUGUGAUGAGUUCUUUGUUCCUUCUUUGACUGUCAUCACUGAAAAACUGGGCAUCUCUGAUGAUGUGGCUGGAGCCACCUUCAUGGCUGCAGGAGGGUCAGCCCCAGAACUUUUCACAUCUCUCAUAGGGGUAUUUAUCGCUCACAGCAACGUUGGCAUAGGCACAAUUGUAGGUUCAGCAGUAUUCAACAUCCUCUUUGUUAUUGGCAUGUGUGCUCUGUUUUCUAGAGAAAUCUUAAACCUGACAUGGUGGCCGCUCUUUCGAGAUGUGUCUUUCUACAUUGUUGACUUGAUCAUGCUGAUCAUAUUUUUCCUGGAUAAUGUCAUCAUGUGGUGGGAAAGCUUGCUUCUCUUAACAGCUUAUUUUUGCUAUGUGGUUUUCAUGAAAUUCAACGUCCAAGUAGAAAAAUGGGUGAAGCAAAUGAUAAACCGCAAUAAGGUCGUCAAGGUGACAGCACCAGAAGCCCAAGCAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-292.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -314.64
Frequency: 0.0000
Diversity: 347.57
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..(((((((.....(((((((..((...((((((...))))))....))....))))..........(((....))).(((((((((((((.((...((..(((((((((((((.((.((((((...(((((((...((((.((((((((((((...(((......)))...)))))..((((.((((((...((((.(((((((((.((.(((.(((((((....(((((....)))))........((((((.....))).)))..(((((((......))))))))))))))...))).)).))))))........((((((..((((...)))).....)).))))(((((((..(..((.((...((((((((..(....)..)))))))))).))..)..))))))).(((((........))))).((((......))))))).))))..)))))).))))((((((.(((.(((((....((((((...((((...(((...(.(((.(((((((((((.(((.....)))..)))))))))...)).))).)...))).))))..))))))...))))).))).))).)))....((.(((((((..((...(......)...))...))))))).))....)))))..))))))..)))))))((((.((.((((((.((....)).))))))..)).)))).......((((((((....((((((.......(((.((......)).)))...(((.....(((((((((((.(((((...((((((...........)).))))))))))))......(((....)))..))))).))).....)))))))))..)))))))))))))).)).)))..))))))))))))))..)))))))))))))))).....)))))))...))).....((((((((((......(((........))).((((((((((((....((((...((((..........))))))))....)))).))))))))....((((((((...)))).).)))))))))..))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..(((((((..,{,((({({{,.||...((((((...))))))....,,....|||}.,{,..,...{({....,}}.(((((((((((((.{(...({..((((((((((.,{,((.((((((.,,((((((({(,({(,,{,{{{{{{{{{{...(((......))).,,||||}.,(({.,{{{(((...{(((,(((((((((.((.(((.(((((((....(((((....)))))........((((((.....))).}))..(((((((......))))))))))))))...))).)).)))))}..,,,,{{{,||,,,{{||||{,|||},,,,{({{{{{|{{{((,({{({.(,.,,..},|||||||..({{{{|..,,,)))))),.{{(((,.,,}))},,|||...,,{{,,,,{|.,.{(((..,,.,|}}},|{{||||{{{|||||,||,.((((.({(((,,.....,.))))},.}}}},,,((.,.....},{{{{{.,.{{||||{||||..)),))),,|||.,,|||.((((((((({........))))))))))}}}.,,}}}...{{||..|||{.{|{||(({{{((||||,..|,.|||,|,.|||,.|}},}}}..||,,,.|||||,.||}}}}.})))))}}(((.(((((......})))).)))},|||},,}}}))}}...,,,}||{{{{{{,...|||||{.......|||,|{.},.,,),})))..}|||,{...{{{,||||,,|,|||||...{{||||,,,,,},,,,,}),})})))))))))}}}}},}|,}},.,},...}}}}},,,,}))))}},|||,,..)))}}))))))))).)).))...))))))))))})})..)))))))))))))))).,.,.))))))),,.))).....((((((((((......(((........))).((((((((((((....((((...((((..........))))))))....)))).))))))))....(({,{((,.,,||}}.,,)))))))))..))))....
Back