Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SMARCC1_0000300
Sequence Length
369 nt
GC Content
0.4390
GUGUGAGAAAUAGCUUUGCUUGGUGAAUGGGAUAAUGUUUGUCAGGAUGCAGUUUAGACAGUCCCAAGUUGGAGGCAGGCCUUGAGGGCAGAAGAUUCUGUGAACCUUGGGGGACAGCUUUUGGGUACUCACAGAUAUAAACCCUGUGCAGAAAAAAAGAAGUGAUUGUUUUCAGGAUGCUUAUAAAUCGAGUGAAGCAAAAGAAGAGGAUUCUGUGUCUGCCAUGAGAUGAACGCCCUGCUCUUCACGAAGGUGUGCCUCUAAUAAAGAGAGCCAAAGCCAGCUGGGUCUCACCAGAUUCCUAUACUUUCUCAAGGAUGUUGGGGGAGGUUAAUCCUUUAUCGAAACUAAAGACUGGUUUAUAAACUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-102.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -110.54
Frequency: 0.0000
Diversity: 58.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((((..(((((..(((((((...((((((..((((((.............)))))))))))).((((((((((.(((((((((((((.....(((((((((((.((((.....)))).))))..))))))).........((.(((((.....(((....(((.(((((....(((((............)))))...))))).))))))...))))))).............))))))))....))))).)))))))))).......))).)))).)))))..)))))))((.....((..(((((((((.....)))))))))..))...........((((((.....))))))......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((((((..(((((..(((((((...((((((..((((((.,........,..)))))))))))).((((((((((.(((((((((((((.....(((((((((((.((((.....)))).))))..))))))).......,.((.(((((.....(((,...{((.(((((....((((({{.......}},)))))...))))).))))))...))))))).}.,.........)))))))),...})))).)))))))))).......)))}}})).)))))..)))))))((..,..((..(({((({{(,....}})))|||}..,,.,}}||||...{{{{{{.....})))}),..,,.})
Back