Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SMARCC1_0029400
Sequence Length
1107 nt
GC Content
0.3993
GCUGGUCUUGAACUCUUAACCUCAGGUGAUCUGACUGCCUCGGCCUCUCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCAUGAGCCACCGCGCCUGACCUGUUUUACUUUAUUGAAAAAUCUUAGAGAUGGAUAUUCUUUGAACCACUGACAUGCAGAGUACAGUACUUUCAUACCUAUUUCAGUGCUGUGACUUUACUAUGAAAACCUUACUGUUUUUCACAUUAAUUUUUUUUUUCCCUUGACAAGGGGUCUCGUUCUAUUGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGAAUGAUCUUGGCUGAAUGCAAUGUCUGCCUCCUGGGUUCAAGUAAUUCUCCUGCCUCAGCUUCCCAAGUACCUGGGAUUACAGGCACGUGCCACCACACCUGGCUAAUUUUUUUAUUUUCAGUAGAGAUGGAGUUUCACUAUGUUGGCCAGGCUGAUCUUGAACUUCUGACCUCAGUUGAUCCACCGGCCUUGGCUUCCCAAAAUGCUGGGAUUACAGGUAUGAGCCACUAUGCCUUGCCAAUUUUUAGGAAAAAUAUUAGGAAACAAAAAUAUUAAAUGACUGGGCCCAGUGGCUCACACCUGUAAUCCCAGCACUUUCGGAGGCCGAGGUAGGAGGAUAGUUUGAGCCCAGAAGUUUGAGACCAGCCUGGGCAAUGUAGCAAGACCUCGUCUCUUCAACUGAUAAAAAAUUUAGAGAAAAAAAAGAAAAGAAAAAUGUUUUACAGUUGAGUCUUUGUCAUACCUUUUUACUUGCAGUUGGUUGUCGUUUGUUUUGGAAUUGGACUAUUCAAAAUUUUUUUUUUCCACCACUGUCUUAUGGUGCUGAGGACUCUUCAUAUUCUCUUAUUUUAACCUUUCCAGAAGAUAUACUUACAUAUUUGCUUUCCCUGAAUAUAUUUUAAUCCAAGGCUUUUUUGUCAUUAGGAAUAUUCCAAUUUCUAUAUUACAUUAUUUAACUGGCCAGUUCAUACCCAUUUCUGUUCAGAUUUAGUUUGUUUGUUUAUUCAUUUAUUUUUAGGAGGUUAUAUAGAAAUGGAUAUUUGUUAAAAAAUUAAGGGUUGGGCAUGGUGGCUAAAGCCUGUAAUUCCAGUACUUUGGGAGGCCAGGGUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-386.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -406.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 258.76
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((((..........))))..))))...((((((.((((((((((((((((((((((((((((...((((((((.((((((((((((((.(......).)))))..((((((((((((((((((((((.((((((.((((((((((((((((..............)))))))).))))...(((((....((((((((.....(((((..(((((((((((((((....)))))..(((((((((((((((...)))...))))))))))))....(((.((........)).)))..((((((...((.....))...))).)))..(((((......)))))...((((...(((....))).)))).((((.(((((((...(((((((((((((.((((..((((((((.((((((((.(((((((((((((..(((((...((((.((.((((((((((((.(((.((((((((((((((((.(((((((((..((((.(.((.(((((((........)))))))..............)).).))))..))))))))).)))))))))))))))).))).)))))))))))).)).))))...)))))..))))))))))))).)))))))).))))))))..)))).))))))))...)))))))))))).)))).......))))))))))..)))))...)))).))))......)))))..........)))))))))).)).....((((((((.(((((.((((((..............(((((........)))))..(((((.........)))))................((.((((((......)))))).)).....))))))...))))))))))))).......)))..))))))).))).)))))))...............((((.(((.............))).))))..(((((((.......(((((((((.....(((....))).....))))))))).........)))))))))))))))).))))))))...)))))))))))))))))))))))))))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((({(((..........)))),.))))...((((((.((((((((((((((((((((((((((((...((((((((.(((((((((.,,{{.......,||}|{{{,,((((((((({((({{{{{(({(,{{{({(.{({(((((((((((((..............))))))))},))),..{{((({{{.({{(((((.....{{{({..{(((((((({(((((....))))}..((((((((((((((,...}})...))))))))))))....(((,{{..{{{.,.,},|||,..,||||,,}||..,|,|,..|||||}}},.(((((......)))))....||||..,,|}}.,||,.,,))}((((.(((((((,..{((((((((((((.((((..((((((((.((((((((.(((((((((((((..(((((...((((.((.((((((((((((.(((.((((((((((((((((.(((((((((..((((.{.(,.{{{,,.,....,{{{{{.,........,}}}}},,,}}.}.))))..))))))))).)))))))))))))))).))).)))))))))))).)).))))...)))))..))))))))))))).)))))))).))))))))..)))).))))))))...)))))))))))).)))).,,....,}}))))}}},.}))))...)))),,}}),.,},.}}}}}..........,}}}|||||}.|,.,...(({{(((({(((({.{((({{,||......,,,..(((((........))))).|||||,..},,},..,,,,,................,||||{{{{......|,},,,.,,.....}))})},..)))}}}}}))))}......}}},.,}}))))).}))}))))))}....,,,......,|{|||.||},,.,,,.||||||))}..,}}||||,{,,,.,,,,..{{{{{{(({,....{{|....,,,.,}}}))))))))},.,..}}},}}}},,.))))))))).))))))))...)))))))))))))))))))))))))))).))))))
Back