Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SMARCC1_0029900
Sequence Length
517 nt
GC Content
0.4043
GCGGAGGUUUGACCUACAGAACCCAUCUCGAAUGGAUCGUAAUGUGGAAAUGUUUAUGAACAUUGAAAAAACAUUGGUGCAGAACAAUUGUUUGACCAGACCCAACAUCUACCUCAUUCCAGACAUUGAUCUGAAGUUGGCUAACAAAUUGAAAGAUAUCAUCAAACGACAUCAGGGAACAUUUACGGAUGAGAAGUCAAAAGCUUCCCACCACAUUUACCCAUAUUCUUCCUCACAAGACGAUGAAGAAUGGUUGAGACCGGUGAUGAGAAAAGAGAAGCAAGUGUUAGUGCAUUGGGGCUUUUACCCAGACAGCUAUGAUACUUGGGUCCAUAGUAAUGAUGUUGAUGCUGAAAUUGAAGAUCCACCAAUUCCAGAAAAACCAUGGAAGGUUCAUGUGAAAUGGAUUUUGGACACUGAUAUUUUCAAUGAAUGGAUGAAUGAGGAGGAUUAUGAGGUGGAUGAAAAUAGGAAGCCUGUGAGUUUUCGUCAGCGGAUUUCAACCAAGAAUGAAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-126.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -135.23
Frequency: 0.0000
Diversity: 116.74
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((((((..(((((..((((((.....))))...))..))))).((((((....))))))....((((((((........))).)))))...)))))).....))).)(((.(((......(((...(((((((.(((............(((.((.......)).)))..............((((((((.(((...((((((.....((((((((((((.((((((((....(((.((.....)).)))..((((...................(((((((((..((.(((((.......)))))...))..)))))))))))))(((....)))..(((.((.(....(((((((((.((((((.((((.......((((((...)))))).....))))..))))....))..)))))))))....).)).))))))))))).)))).))))))))......))))))...))).))))))))))).)))))))..)))....))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((((((((..(((((..((((((.....}})).,.))..))))).((((((....))))))....((((({((,,......)}}.,))))...)))))).....))).)(((.(((,,....(((...(((((((.(((.......,,...{{{.{{.......}}.}}}..............((((((((.(((...((((((.....((((((((((((.(((((((({,..{{(.((.....}}.)}}..|,,{,.,................(((((((((..((.(((((.......)))))...))..))))))))).{||{{{.,,..,|,,,{{,{{,|,...{{({{{{{({{{{{{,,((((.....,,{,||||.}}}}}}}}.,...))))}})))),,,.}},.,))))))})..,})}))...))))))))).)))).))))))))......))))))...))).))))))))))).)))))))..))),..}))))))
Back