Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_SMARCC1_0031300

Sequence Length

907 nt

GC Content

0.3528

GCGUCCAUUUUCUAAGCUAAAUUCAGACUACCAAAGAAGCACAUGAUUACCAGUGCUGAAAUGUGGAGGUAAUUUAACUGUGAUUAGAAUACUAAGAAUCACUUUAUUAUAUAAUUUGCACUUAUCUUUGGAAAAAAUUUUUGAAAAAAAGUCUACAAUAUGUAAUCACAUUGCUUACACUCUUGUUGGGAGGGCUAACAGGUAUGAGGCAGUGAAAGAAUAGUAAAAAUAGUAUUUUUGGUAAAAGCUUUGAUGUAGCACUUUACAGCUUAUAGGACAUCAGAAAAAGGGAAUCUAGAGGAAGCAGAGUAGUUAGUAAAACUUUCAUCAAUGAGAUGAAGUACGGUUUACAUCUUGAAAGAUGUGUAAUAAUUGCUAAGCCUCACAGAAAGAGGGAUGAGAGGUUCACCAUGGGAAGUGAAACAUUAAAUAAUAUGGUGAUUAUUAUUUUGAUAGAAGAGAGAGGGGAGGCUGGUGGGUGAAUGGGAUGGGAGUAUUUUACCGCAGUGGAUAAUUGGUUUUGUCAAGAGUGAUGGAUAGUAGACCUACAGUUUGGAAAGUCAGAAAGACUGAGAAAUUUCCCUUUAAUCUGGUAGAUAGUACUCAAUUUGAAAACUUUUUCUUUCCAAACCAGCAACAGCAUGUUCGAAAAAUGUUGUUCGUUAGCAAACUAAAACAUCUUAGUAAAAAUUAAGGCUAAAAAUCAUAGUUUCUUUAUUAUUUUGUCAGUUUGAGUAAAGUUGUUUCUUUUUCUCUUCCAGAAGAAUGGUUGAGACCGGUGAUGAGAAAAGAGAAGCAAGUGUUAGUGCAUUGGGGCUUUUACCCAGACAGCUAUGAUACUUGGGUCCAUAGUAAUGAUGUUGAUGCUGAAAUUGAAGAUCCACCAAUUCCAGAAAAACCAUGGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-210.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -227.27

Frequency: 0.0000

Diversity: 219.71

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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