Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SMARCC1_0035900
Sequence Length
356 nt
GC Content
0.4635
GGCUGGAGUGCAGUAGGGCGAUCAGGGCUCACCGCAGGCUCAACCUCUCAGGCUGAAGUGAUCCUCCCACCCCAGCCUCCUGGAUAGGAUUGCAGGCAAAGUGUUUCAUGGAUUUCAAAGCUGGAGGCGCCUUAUGUCACAUUCUUGGGGCUGCUUACAAGUAUAAAAAUGAACAGGGAUGGCGGAGGUUUGACCUACAGAACCCAUCUCGAAUGGAUCGUAAUGUGGAAAUGUUUAUGAACAUUGAAAAAACAUUGGUGCAGAACAAUUGUUUGACCAGACCCAACAUCUACCUCAUUCCAGACAUUGAUCUGAAGUUGGCUAACAAAUUGAAAGAUAUCAUCAAACGACAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-81.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -90.20
Frequency: 0.0000
Diversity: 99.50
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((..(((((((((((((((.((((..(((.((.........)).)))..)))))))).......(((((((..((((..(((...((((.....(((((..(..........)..)))))))))...)))..))))..)))))))......................(((((((..(((((...)))).).....))))))).....)))))).((((...((((((....))))))......))))((((.((((.......)))))))).........)))))..)))))))).).....)((((.((((...........................)))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((..(((({((((((.(((.{,.|,,{{{|{{|,.,,,.,.((((((..(((.......)))..)))))}({{{,{..,|..}.}}||{...,{(((((,{{..,,.....,|{,}||||||{|{{.|,,.....}.)))))),))}..,.,}}......,},,,},(((((((.,|{(((...)))).}.,...))))))).....)))))).{((({{.((((((....))))))......,},|((((.(((({(....))))))))),..}}..,,)))))..)))))))).).....}((((.((((..........{................)))).))))
Back