Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SMARCC1_0039300
Sequence Length
829 nt
GC Content
0.4608
GCUGGAGUACAGUGGCGUGAUCAUAGCUCACUGCAACCUCAAACUCUUGCAUUCAGCUCAUGCAUUCAGUGAACAACUGAGCAUUUACCAUGUGCCGGGUACUUAAAGUAUAACUCACUUAAAGUCCUCAUAGCAGUCCUAAAUGAUAGAUAUUAUUUACCUUCUUUUUCAAAUGGAAGAUACCUGAGACUUCAUUUAGGAAUUUUCUUUUUUUUUUGAGACAGGGUCUUUCUGUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGUGAGAUCAUAGCACACUGCAGCCUCAACCUCCUGGGCUCAGGUGAUUCUCCCACCUCAGCCUCCUGAGUACCUGGGACUACAGGCACGAACCACCACACCUGGUUAAUUUUUUGUAUUAUCAGUAGAGGCAGGGUUUUGCAGUGUUGCCCAGGCUGGUCUCGAACUCCUGGGCUCUCUGCCUGCCUCAGCCUCCCAAAGUGCAGGGCUUACAAGUGUGAGCCACCACACUUGGCCCACACUGACUCUUACUUGAAAUAUUUUGAGACUAAUAAAUUUUUGUUUUCUUAAAUAAAAUAUAAUAGACUUUUUUUGAUCAAAAGAUUAAUUGGGCCAGGUGCAGUGGCUUGCGUCCGUAAUCCCAGCACUUGGGAAUUCCAGGUGGGAGGUUCAUUUGAGCCCAGGAUUUGGAGACCAGCUUGGGCAACAUGAUGAGACCCUGUCUCAAAACAAAACAAAACAAAAAAAUACAUCAGUUGUGGUGGCAUGCACGUGUAGUCCCAGCUACUUGGCUGAGGCAGGGUCCUUGGAGGAUCACUUGAGCCUAGGAGGUCGAGGCUGCGGUGAACUGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-375.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -388.52
Frequency: 0.0000
Diversity: 134.76
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((....))(((((.((((((((...((.(((((((..(((.......(((((.......))))).(((((.....)))))((((.....))))((((((((.....((.(..((((.(((((((............((((((((((.((...(((..((.(((((.........))))).))..)))..))))))))))))............)))))))...))))..).))....))))).)))..))))))))))))..)))))).)).((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((.((((..((((((((((((.(((((((((((((((....((((((((.(((((((.((((((((.......((.((((((((((((((..((((((((((((((((((((.((.((((((((((.......(((((.(((((((((.((((.(((.((((...((((((((((..(((((((((((...(((.((((..((((........(((.(((......((((((((....)))))))).....))).))).......)))))))))))..)))))))))))..))))))))))...)))).))).))))))))))......)))..)))))......)))))))))).)).))))))))))))))))))))..))))))))))))))...))........)))))))).)).))))).))))))))..))).).))))))))))).)))))))..))))).))))....))))))))))))))))))))))))).)))))))))))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((....))(((((.((((((((...((.(((((({..{{{.......,(({{...,,..||||,.(((((.....)))))|{{{......,}}||.(((.((((.((((.......)))).)))),)},...,,,.((((((((((.{{...{{{..{{.(((((.......,.))))).}}..}}}..},)))))))))}....,||,........)))|,{|||,...,}}}},.,))}}.)))})))))))))))))..)))))).)).((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((.((((,.((((((((((((.((((((((((({({{.{..((((((((.((((({{.((((((((.,.....((.((((((((((((({..((((((((((((((((((((.((.((((((((((...,{{{{(((,.((((((({{{((((.(((.((((...((((((((((..(((((((((((...,,,.(({,..{{{{......,,(((,{{(,({...{{{{{({{....))))))))..,,.})).}}}...,{{,||},,}))))),.)))))))))))..))))))))))...)))).))).)))))))))).....})))}})))))......)))))))))).)).))))))))))))))))))))..})))))))))))))...))......,.)))))))).)}.))))).))))))))..))}.).))))))))))).)))))))..))))).)))}....))))))))))))))))))))))))).)))))))))))).)))))
Back