Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_STRN3_0000400

Sequence Length

2591 nt

GC Content

0.3620

GUGGAGGUUUUACUGAGCAGAGAUCACCACUGCAUUCCAGUCUGGGCUGGUGACAGAGUGAGACCCUGUCUCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGUACCAGUCAGGUGUACAUGUUCUCUUAAAACAGUUUUUAGAUAUUACAUAAAUUCAGAGGUUGGGGGAAUGGAGAUUUGAGUUUCUUCUUAGAAUUUAUCAGUAAUUUGUUUUUCCUCUCUUCCUACAAUAGCGGCCCUGUUCUGUCAUUAGCUAUUAGUUCUAAUGGAGAACAGUGUUUUAGUGGUGGUAUUGAUGCAACCAUCCAGUGGUGGAAUAUGCCGAGUCCCAGUGUAGAUCCAUAUGAUACAUAUGAGCCAAAUGUUCUAGCUGGCACUUUAGUUGGUCAUACAGAUGCAGUUUGGGGUCUUGCUUAUAGUGGCAUAAAAAAUCAAUUACUGUCUUGUUCAGCAGAUGGCACUGUUAGGUUAUGGAAUCCACAAGAAAAAUUGCCAUGUAUUUGCACUUACAAUGGAGAUAAAAAGCAUGGAAUACCUACAUCAGUUGACUUUAUAGGCUGUGAUCCAGCUCAUAUGGUAACCUCUUUCAACACUGGUAGUGCAGUAAUUUAUGAUUUAGAAACAUCACAGUCAUUGGUGAUACUUUCAUCACAGGUAGAUUCUGGUUUACAAUCUAAUAAUCAUAUCAACAGAGUAGUAAGUCAUCCCACACUUCCUGUUACAAUAACUGCUCAUGAAGAUAGACACAUCAAAUUUUUUGACAAUAAAACGGGUAAGCAAAUUGUCUUCUUUUCAUAUUAGUAAUACUGUAAAUUUGAGAUGAUCAAAAAUGCUGUUUUAUGUAAGAUAUAUUGACUUUUCAGAUACGAAAUUGCCAAAUGAAACCAUUUUAACUCAGAUUUUUGCUUUUCUUAAUGUUGCACGCUUAUGAUUUGUUAUUUUAUCCUUAACUAGACAUAAUACCUUGCCUAGCUAUUACGAUUUCUUCAAGUCAUGUUAGUUAAAUGUAGAUCCUUCCAUUUGAAAUUUUUCCCUCAUAUUCUGUUAUGAAUAAGUAUGAUGGAAGAGGUAGAUCUCUUUCUGGUGUUUGGCAUUUCCAUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGGCGGAGUUUUGCUCUUGUUGCCCAGGCUGGUGUGCAAUGGUGCAAUCUCAGCUCACUGCAAUCUCGGCCUCUUGAGUUCAAGCGAUUAUCCUGCCUCAGCCUCCCGAGUCGCUGGGAUUACAGGCAUGCACCACCAUACCUGGCUAAUUUUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCUCCAUGUUGGUCAGGCUGGUCUCGAACUCCUGACCUCAGAUGAUCCACCUGCCUUGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCAUGAGCCACCGCGCCCGGUCGUCCAAUAUGUUCUUACAACUAUGUCUCAGUGGAUCAAAUGACAUUAUAGUGCAUAGUGUUUAUUAUCAUCUUCCCUGUAUUUCUUGUUGUAGGGAAAUAUACCAGUUGUAUUGAAGUCGAAUCAGAUUUUAACUUAGCCAUAGAUGUGUGGUUGUUUUUUGUUUGUUUGUUUGUUUGUUUUGGGCCUCUUUUUUAUCUAGUCAUUACCUAGAAUAAUAGAUAAUAGAUAGCUUGCUCUCUUUCAGGAAAGGUCUGACAGCUAGGAAGGCUACUUUGAGGAGAGGCUAAAACAGUCAGGGUACUGAAGGACUUCUAAAUAAGAAAUGUAAAUGUUAAUUGCAACAUUGUUACAGGGUAACAAAUUAUCAAGUAAGACAGUGACCCAGAAUUAUAGGUUUCUCUUUGAAGAUUAUAUAGAAAAUGGCAAUAUGUUUUAGUCUGUAGUCUUAACAAUGAGACCCUUUUGUUCAAACAUUACUUUCAUGGACAGAUUCUUUUUAACAAAUUGCAGACAAAGUGAAUAUUUACAGGUCUACAUUGUGCACAGGACAUAAGAUUCAAGUGGAUGUUCUUUUUAAAAAAAAUAUUUAAAUUUUUUUUUUUUUUUAUAGAGACAGGGUCUCACUGUGUUGCCCAGGCUGGUCUUAAACUCCUGGGCUCAAGUAGUCCUCCCAUGUCAGCCUCCCAAAAUGCUGGGAUUACAGGCAUGAGCCACUGCUCCUGGCCAGUGUUCCCAAUUUAACACUUCAUCAAAUCAAUCCUUUGAACUAUUUUUAUGAAACCGAUAAUGUUUUUCUCUGCUGCAAGAGCAAAGAGGUUAAUUUCCUUUGUGUUUCUAAAAAGAUUCCUGUUUAUUAAUUAUUGAAGAUUUACAGUUAUAUGGGAAAGUUCAGGAAUUUUAGUAGUUAUAUUAAAAGCAAAAGGUGAGCAUCUGAAAAGCUAUUUUAUUAGCAGAAAUCAAGAAAGUGGUCAGUAAAAGCUUACUCAAUAUCAAAUAAGCAGCAUAUAGUCUUUCAAAUUGUUUCCAAAUUUCACCUAUUUAUUAUUUCUGUUAACUAGUACCUUACCUGUAGUAUGAAGAUAAUUGAAGCAGUAGGCUCCAAAUAAUAGAAAAAAAAAUCCUUUUUUUUUUUUUUUGAGCCAGUCUUGCUCUGUUGCCCAGAGCUAUAGUGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-665.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -721.86

Frequency: 0.0000

Diversity: 825.21

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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