Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_STRN3_0005100

Sequence Length

1092 nt

GC Content

0.4222

GCCCGGAUUGCAUUUCUACAAGGCGAAAGAAAAGGUCAAGAGAACCUGAAGAAGGACUUAGUAAGAAGAAUAAAGAUGUUAGAGUAUGCAUUAAAACAAGAAAGGGCAAAAUAUCACAAAUUAAAAUAUGGCACGGAACUGAACCAAGGUGACUUGAAAAUGCCAACCUUUGAGUCAGAAGAAACCAAAGACACAGAGGCUCCCACAGCACCUCAGAAUAGCCAGUUAACGUGGAAGCAAGGCAGACAGCUUUUAAGACAGUAUCUUCAGGAAGUAGGUUAUACAGAUACAAUAUUAGAUGUACGGUCUCAGCGGGUAAGGUCAUUACUUGGACUAUCUAAUUCAGAACCAAAUGGAUCAGUAGAAACAAAGAAUUUAGAACAGAUCCUGAAUGGAGGUGAAUCUCCUAAGCAAAAGGGACAAGAAAUAAAAAGGUCCUCUGGUGAUGUUCUUGAGACGUUCAAUUUCUUAGAAAAUGCCGAUGACAGUGAUGAAGAUGAGGAAAAUGACAUGAUCGAAGGCAUCCCAGAAGGAAAAGACAAACAUCGGAUGAAUAAACAUAAAAUAGGUAAUGAAGGUUUAGCUGCUGACCUAACUGACGAUCCUGAUACUGAGGAAGCACUGAAAGAAUUUGAUUUUUUAGUGACUGCUGAAGAUGGUGAAGGAGCUGGAGAAGCACGGAGUUCGGGGGAUGGCACAGAAUGGGAUAAAGAUGACCUCUCCCCAACUGCUGAGGUUUGGGAUGUAGACCAGGGACUAAUAAGUAAACUGAAGGAACAGUACAAGAAGGAACGAAAGGGGAAGAAAGGGGUGAAGAGGGCCAACAGGACAAAACUCUACGACAUGAUAGCUGAUCUGGGAGAUGAUGAGCUGCCCCACAUCCCUUCAGGAAUCAUUAAUCAGUCUAGGUCAGCCUCUACUAGAAUGACUGAUCAUGAAGGUGCAAGAGCAGAGGAAGCUGAACCAAUAACGUUUCCAUCUGGAGGAGGCAAGUCAUUUAUUAUGGGUUCUGAUGAUGUUUUGUUAAGUGUACUGGGCCUUGGAGACCUUGCAGACUUGACGGUAACAAAUGAUGCAGACUAUAGUUAUGAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-256.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -280.58

Frequency: 0.0000

Diversity: 259.84

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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