Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_STRN3_0012300
Sequence Length
621 nt
GC Content
0.3994
UAGAUUCAUUAAAAUCUUGUCAUGGAAAAGACACUAGGAUUUGCAAAUUACUAUUCCAGACCAGCUUUUGAAAACCCUGAAAAUGGAAAAUUCAGGAGAUUCCCCCCUUAAAAAUGAAGAAAUCAAGCCCGGAUUGCAUUUCUACAAGGCGAAAGAAAAGGUCAAGAGAACCUGAAGAAGGACUUAGUAAGAAGAAUAAAGAUGUUAGAGUAUGCAUUAAAACAAGAAAGAAACCAAAGACACAGAGGCUCCCACAGCACCUCAGAAUAGCCAGUUAACGUGGAAGCAAGGCAGACAGCUUUUAAGACAGUAUCUUCAGGAAGUAGGUUAUACAGAUACAAUAUUAGAUGUACGGUCUCAGCGGGUAAGGUCAUUACUUGGACUAUCUAAUUCAGAACCAAAUGGAUCAGUAGAAACAAAGAAUUUAGAACAGAUCCUGAAUGGAGGUGAAUCUCCUAAGCAAAAGGGACAAGAAAUAAAAAGGUAAUGAAGGUUUAGCUGCUGACCUAACUGACGAUCCUGAUACUGAGGAAGCACUGAAAGAAUUUGAUUUUUUAGUGACUGCUGAAGAUGGUGAAGGAGCUGGAGAAGCACGGAGUUCGGGGGAUGGCACAGAAUGGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-128.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -140.84
Frequency: 0.0000
Diversity: 155.98
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((.....((((((((((........))))...))))))...)))).((((((....(((.((((((((...((.......))....))))))))..((((((........((.(((((((((.......))).)))))).)).(((..........)))..(((..(((.....))).)))...............(((((........)))))............................((((((....((..(((......(((.(((........)))..)))...((((((((....((.(((((((((...((.(((((((((..((......))..)))).((((..(((((.((((.(((((((((......(((.(((((...(((...(((((.((..................)).)))))....)))...))))).((((........))))..))).......)))))))))...)))).)))))))))))))).))..((((.......))))((((((((((((......)))))))))).)).))))))))).)).)))))))))))..))..)))))).)))))))))....)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{{,{{.....((((((((((........)))}...))))))...,.},.||{(((,,,.{{{.{{{{{{{,...(({,,,...}}....))))))}}..((((((,.......{{.{{{{{{{{(,,,,,..}||,}|||||.|,.({{........,,|||....|..|||.....,}}.|||.,,............(((((........)))))............................{(((((..{{,({,(((,,....{(({{{,....|||,|||..|||...,,||||||....(({(({{,(((({(.((.(((({{{{{..((......}}..)))).(({,,((((((.((((.(((((((((,.....|||.(((((...(((...(((((.((.,,,........,}}...}).)))))....)))...))))).((((........)))}..,,,.......)))))))))...)))).)))))))))))))).})..}}))))}}})},,,,,{((((((((((......)))))))))).)).)))},),)).))..)))))))}})..)),,)),))),))))))}))....)))))),
Back