Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_STRN3_0019100
Sequence Length
618 nt
GC Content
0.3964
GUAGCAGGUAAUUGGAAUGAGUUAGGGUGGAGCAAGUGAUUGGAACGUAGAUUGGAGCAGGUGAGUCAGGGUGGAGUAGGUAAUUGGAAUGAAUCAGGGUGGAGUAGAUAAUCGAAAAAGAUUGCUUUACGAGGAAGUUUAAGUUUAAAAGUAGAAGGCAAAGAAUUGAACAUACUGACAUAUUCUUUGAAAAGAAAUUUAGAACUCAUAUCUAACAAUCCCUCCCCUUGUGUUUCCUUACAGCUUUCUUUUCAAACUUUUUUUUAACAUGUCUUGGCUUAGUUGUUUUGCUUGACUUUCUGAAAGAAGAAGCUUCUCUGGAUAAGGUGGAGGAUAGUUAAGGGAGGUUUUAGUAAAUGCCAUUUUUAUGAGCCUCUGCAUCUACUUACGGAUGCAUGGUAUGACACAGCACCCGACAAGAAUAAGUACACCUAUUAUGGCUGCAAGGGAAGAAUUGAGGCUAUUAUUCCUUUCCAUUUACCGAACUACUUUUUUUUUAGCCAUCCUGUAAAGGGGUCAUUUACCCCUGAGUUGCUGUCUGACUCAUUGGAUAGAGCAGUGAGACCUUGCAGUGCUUUUGUUAUACUUUUAUUAGGGGCGGUGCUGUUUGGGAUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-149.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -161.54
Frequency: 0.0000
Diversity: 225.44
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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