Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_STRN3_0020500
Sequence Length
1513 nt
GC Content
0.4369
GAGAAUCACUUGAACCCGGGAGGCGGAGGUUGCAGUGGGCCGAGAUCACGUCACUGCACUCCAGCUUGGGCAACAGAGCAAGACUCUGUCUCAGAACAGCAACAACAACAACAAUUUUUGCACUUUCAGGACACUUACAGGCUCCUUCCUAUAAUCCCAGCACUUUGGGAGACCAAGGCAGGAGGAUAACUUGAAGUCAGAAAUUCAAGACCAAUCUGGGCAACAAAGUGAUACCCUGUCUCUACAAGAAAUUUAAAAAAUUAGCUGGACACAAUGGUGUUGUACCUGUAGUCCUAGCUACUCGGGAAACCGGGACGGGAGGAUCGCUUGAGCCCAAGGGGUCAAGGCUGCUGUGAGCCAUGAUCUCACCACUGCACUCUAGUCUGGUCAAUAGACUGACACUCUGUCUCAAAUAAUAAUAAUAAUAAUAAUAAUAAUAAUAAUAAUAAUAAUAAUAAUAAUAAUAAAAUUGCUUUGAGAAGCCAAGGCAGGAAGAUUGGUUGAGGCCAGGAGUUCGAGACCAGCCUGGGCAACAUAGUGAGACCCCCCCCGUUUCUACAGAAAAGAAAAAAUUUAGCCAGACAUAGUGACAUGCACCUGUAUUCCUAGCUUUGGAGGCUCAGGGGAGAGGAUUGCUUGAGCCCAGGAGUUUGAAGUUGUAAUGAGCUAUCAUCACACCACUGCUCUUCAGCCUGGUAAAAGACUCUGUCUCUUUAAAAAAAAUUAUAUUUUGAAUAAGUAAUAUGUGGUUCAAAAUUAAGUCUUAUACUCACCAUGAUCCUGUCUACCACCCCCCACUGCCAAGUUAGUAAUCGACUACUUUUUUUUUAGUCUGUGUGUGUCCCUCUCUAGUGUUUUUUAUGUAGGUAGAUGAAAGCAAAUGUUUUCAUCCUUUUCUGGUACAAUGUGGCAAACUAUAUAACCUAUUUUUCACUAUAAUUUUUUUGUUUUUUUUUUGAGAUGGGGGUCUCACUCUUUUGCCCAGGCUGGAGUGUGGUGAUGCGAUCUUGGCUGGCUGCGACCUCUAUCUCCUGGGCUCAAUUGAUCCUCCCACCUCAGCCUCGCAAGUUUGGAACUACAGGAACCUGCUUCCACACCUGACUAAUUUUGUUGUUGUUAUUGUUUUGUAGAGAUGGGGGUCUCCCUGUGUUAUCCUCCCACCUCAGCCUCCAAAGUUUGGGACUACAGGAACAUGCCUCCACACCUGACUAAUUUUGUUGUUGUUAACUGUUUUGUAGAGAUGGGGGUCUCCCUGUGUUAUCCAGGCUGGUCUUGAACUCCUGAGCUCAAGCAUUCUGCCCACCUCAGCCUCUCAAAGUGCUGGGAUUAUAGGCAUGAACCACUAUGCCCUCCCUACUUUACUUUUUCAUUUCACAUGUUGAGAGAUCAUUCCAAACCUGCUAAUAGAGAGCAUCCUUACUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACGGAGUUUUGCUCUUAUUGCCCAGGGUAGAGUGCAGUGGCACAAUCUCAGCUCACUGCAACCUCUGCCUUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-587.83 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -611.48
Frequency: 0.0000
Diversity: 231.85
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(..((....)).))(.((((((((((((((((((((((.(((((...((((((((((((.(.(((((((((.((((((((((((((((((((((..((((...............))))......((((..((...))..))))...((((((((((((((((((((((....((((((..((....((((((........)))))).......(((((....((((((..(((((((((...................((((((((((((..((((...))))))).)))).)))))...((....)))))))))).)..))))))..))))).(((((((.((((......)))).))))))).)).)))).)).(((((((.....)))))))........(((((((((((...................................................)))).))))))).((..(((..((.(((.((.(((((..(((((((((((((((((((((((.(((((((.(((((((((...((((((((((((......(((.((((.(((.......(.((((..((((((.(((((((((((((((((.(((((.((((((.(((((((((((((((...((.((((((.(.(((((..(((.((.((((((.(((((((((((((((((((((((((((....((((((((((((...((((.(((((.(((((((((.........(((.(((....((((.((...(((((((.......(((((...((.((...((.(((((.........))))).))...))...))...)))))........)))))))(((((((((....)))))))))....))))))...))).))).)))))))))...))))))))).))))))))))))...........))))))))).......))))))).))))))))))).)))))).)).)))..))))).).)))))).))...)))))))))))))..((..((((((.(((.((...((((((.(((((...(((....))).))))).)).((((.(((......)))))))))))...)).))).))))))..)).....)).)))))))).))).))))))))))).)))))).))))))..)))).).......))).)))).)))((((....))))..))))))))))))))))))))).))))))).)))))))))))))))))))))))..))))).)).))).))..)))..))))))))))))))))))))))))((((((......)))))).............(((((((..........)))))))............((((.......))))...................))))))))))))))))))))))..))))))))).).))))))))))))...))))).)))))))))))))))))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.,..{{....},.})(.((((((((((((((((((((((.(((((...((((((((((((.(.(((((((((.((((((((((((((((((((((..((((...............))))......((((..({...})..))))..{((((((((((((((((((((((....{((({({,((....((((((........)))))).......(((((....((((((,.(((((((({...................((((((((((((..((((...})))))).)))).)))))..{((....)))))))))).).,))))))..))))).(((((((.((((......)))).))))))).,,.}}}}.,,..((((((.....))))))|{{,...,}}|,,,..........................................................,|{{{|||.,..,,}}}||}}((.(((.((.(((((..(((((((((((((((((((((((.(((((((.(((((((((.,,((((((((((((.{,..,(((.((((.(((.....{.(.((((..((((((.(((((((((((((((((.(((((.((((((,({(((((((((((((...((.((((((.(.(((((..(((.((.((((((.(((((((((((((((((((((((((((...,((((((((((((...((((.(((({.(((((((({.........{,.........,....||....|,,,,,,,.....,{{((,,,,{,,,{,.,,.(((((.........))))).},,.,,,..,{,...|||||.....,,.}}}))..(((((((((....)))))))))......,}}|}|.,}}})}},}))))))))...))))))))).)))))))))))}...........))))))))).......)))))))})}))))))))).)))))).)).)))..))))).).)))))).))...)))))))))))))..||,||||{{{.{{(.((...{(({({.(((((...(((....))).))))).}}.{(((.{{{......)}})}}},}}}...)}.))).})}))),..,.....)}.}))))))).))).))))))))))))}})))).))))))..)))).}.......))).)))),))),||,....,,,}..))))))))))))))))))))).))))))).)))))))))))))))))))))))..))))).)).))).))..)))..)}))))))))))))))))))))))|(((((......)))))}.............{((((((.,......,.))))))}............{{{{....{{{||,,......,,,,,........))))))))))))))))))))))..))))))))).).))))))))))))...))))).)))))))))))))))))))))).)
Back