Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TMEM165_0004900
Sequence Length
1523 nt
GC Content
0.4642
GCAAAUCACCUGAGGUCAGGAGCUCGAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAAAAUACAAAAAUUAUCCAGGCAUGGUGGCCCACGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGACAGGAGAAUCUCUUGAACCCGGGUGAGCCGAGAUCGCGCCACUGCACUCCACUCUGGUCGACAGAGCUAGAUUCCAUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACGACUCAGUAUACAAAUAAAGACUGGAAAGUCCUAUAUUAAAGGAACUAGUUAAAUACUAGUUUAUUUUACUUAAUCUAGUGAAUUUUUAAAUAUUUUCUUUCUUUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACAGGGUCUGGCUCUGUCAACCAGGCUGGAGUGCAGUGGCACAAUCUCAGCUCACCUCAACCUCCACCUCCUGGGCUCAAGCCAUCCUCCCACCUCAGCCUUCUGAGUCUGGGACUACAGGUUCCCACCACCAUGCCUGGCUAAUUUUGUAUUUUUUGUAGAGACAGGGUUUUGCCAUGUUGCAGAGGCUGGUCUCGAACUCCUGAGUUCAUGCAAUCUGACCACCUUGGCCUCCCAAAGUGCUGAGAUUACGCCCGGCCUAAAUAUUACUUUCAAAUAGAACCAUCUUCAUGGGUAGCAGUUUAUAAUACACAAGUAGAAUUUGGGAAAUGUAGUCCCAGUCUUCCAUUCUUCACAGUGGAUGCUUCAGCCAGUUUCCUGUCUCUGCACACACACUGCCCGACAGCGGGCUUUCCCUUCUCCUUCAGAGCAGUAGCAGUUCCCUUUCUUCAUUCCCACCCAUCACAGUGGCAGCCCCCUCUGCCCUCCUGUAUUCUGAAUCCCACCCUUAUAAUAUGCUUAGAUUUUGCCUUUCUCCCAGCCGUUUUGUGAGCAUUGUUCGUGUGUACCAAUUUUUUCUCAUCCUUUAAAAAGAAAAAAAAAAAGCCCCUUUUCUCAAUUGUACAUCGCAAAUCCAACUCUUGCCCUCCUGCAGUGUCAGAGGACUUGGCUGUGAUGGGAAUAAGCCUUGGCUCUGUUCUCCUUGCAUACUUAGCCCAUGGGAACCCAGUUUCUGGCCUCACCAGGAAUGUUGUUGUGCUUUGAGCUCCCUGUGGCCUUGCAUGAUGCCUCCGUUGGUCCUUACAGGAGGUGAUUGGCUGGCCACCUCACUUGCUUUCUCCUGUGGACCCUUCUUUCUCUGUCCUUCCUUGAAUGCUGCCUUUGUCCCUCAUGAUUAUGCUAUCAACAUUCUUCUCUUUCUGCUUUCUCUGUAACAGGUUUAUUGACUCUUUUUUUUGAGAGUCUUGCUCUGUCACCCAGGCUGGAGUACAGUGGCACAAUCUUGGCUUGCUGCAACCUCUGCUUCCUGGGUCCAAGCGAUUCUUCUGCCUCAGCCUCCCGAGUAGCUAGGAUUAGAGACAUGUGCCACCAAGUCUGGCUAGUUUUUGUAUUUUUAGUAAAGAUGGGGUUUCACCAUGUUGUCCAGGUUGGUCUCAAACUCCCAACCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-569.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -594.38
Frequency: 0.0000
Diversity: 235.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.......)(((((((..((((...(((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((.((((((.(((((((.((.(.((.((((((.(((((((((((((((((((.((((((((((.((((.((((((((((((.(((((.(.((((((((((((((.((((((.(((((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((.(((...(((((............)))))...)))...........((((((((.....))))))))..((((((......)))))).......................)))))))))))))))))))))))))..))))))))))))))).)))))).)))))))))))))).).))))).)))))))).........((....))((.(((((((...(((((.(((((....)))))..))))).....((((((((......((...((((((...((((.....(((((((((((((..(((.(.((..(((((((((((((..(((((....))))).........)))).....)))))).......((((.(((((((.....(((((((.((((((..........((((....))))(((...........)))..)))))).)))))))...))))))).))))..((((((......)))))))))..))).)))..)))))))))))))........(((((....)))))...............(((((((.(((......(((............((((((((((.(((((......)))))))...((((.((((((......(((((((.(((((.(((.........)))...)).))).)))))))....))))).).))))...((((((((............))))))))....((((..((((((..((((((....((((.........)))).....))))))...))))))...))))))))))))...))).....))))))))))...))))...))))))))))))))))..((((((((.....))))))))...(((((((((((.(((((..((((((..((..(((((((((((........)).)))))).))).)).)))))).......((.(((......((((............))))......))).)).((((..((......((((......))))...............(((.......)))((((((.....(((((((......)))))))..)).)))).))..)))).))))).))).))))))))..)))))))..))..............)))).)))).)))))))))).))))))))))))))))))).)))))).)).).)).))))))).)))))).)))))))))))))................))))))))))))).)))))))))))))...))))..)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.......)(((((((..((((.,.(((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((.((((((.(((((((.((.(.((.((((((.(((((((((((((((((((.((((((((((.((((.((((((((((((.(((((.(.((((((((((((((.((((((.(((((((((((((((..((((((((((((((((((((((((((((.....{(((...........,|}}}{{{{|},..,{,{{,,{|((((((((.....))))))))..{(((((......)))))}..,,,.,,}}}...}},)}..)))))))))))))))))))))))))))..))))))))))))))).)))))).)))))))))))))).).))))).)))))))}......{{,,,...,))|,.(((((((...(((((.(((((....)))))..))))).....((((((((......{{...((((((...((((.....(((((((((((((..{((...((..((({(((((((,{..(((((....)))))..,.,{{{{,|,|{{.{{{|,,,,}}}}.}}|,|,}||||,{|.,,,}|||{{{{.{{{{{{,,.....||.((({....,)))||,....,......,}}..,})))}.}}}||||{..,,,}}))}))))},((((((......)))))))))..))}.}),..)))))))))))))........(((((....)))))...............{((((((.(((,{....,,..{{,.{{{{{,.,,{((((((({(((((......)))))...,,((({.{{((({......(((((((.(((((.(((.........)))...))},)}.)))))))....))))}.|,||||...((((((((............)))))))}.,,,((...|||||....||{|||}}..((({.........}))).....}))))}}.}))))),,,,,)))))))))))))})))....,))))))))))...))))...))))))}}))))))))..((((((((.....))))))))...(((((((({((.(((((..((((((..((..{{((((((({{........}).)))))).,}}.)).)))))).......((.(((......((((............))))......))).)).(({{..{,......{(((......))))...............,{{.......||,((((({.....(((((((......)))))))..}}.)))).,,..)))).))))).))}.))))))))..)))))))..||,.....}}}.....)))).)))).)))))))))).))))))))))))))))))).)))))).)).).)).))))))).)))))).)))))))))))))},..............,}))))))))))).))))))))))))).,.))))..)))))))
Back