Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TTBK2_0001000
Sequence Length
1762 nt
GC Content
0.4711
AUUACAAUUCCUAGACCUUCUGUGGCAUCUACACAGUCAACUUCAGGAAGCUUUCACUGUGGUCAGCAGCCAGAGAAGAAAGAUCUUCAGCCCAUGGAGCCCACUGUGGAACUUUACUCUCCAAGGGAAAACUUCUCUGGCUUGGUUGUGACAGAGGGUGAACCUCCUAGUGGAGGAAGCAGAACAGAUUUGGGGCUUCAGAUAGAUCACAUUGGUCAUGACAUGUUACCCAACAUUAGAGAAAGUAACAAAUCUCAAGACCUGGGACCAAAAGAACUUCCUGAUCAUAAUAGACUGGUUGUGAGAGAAUUUGAAAAUCUCCCUGGGGAAACUGAAGAGAAAAGCAUCCUUUUAGAGUCAGAUAAUGAAGAUGAGAAGUUAAGUAGAGGGCAGCAUUGUAUUGAGAUCUCCUCUCUCCCAGGAGAUUUGGUAAUUGUGGAAAAGGAUCACUCAGCUACUACUGAACCUCUUGAUGUGACAAAAACACAGACUUUUAGUGUGGUGCCAAAUCAAGACAAAAAUAAUGAGAUAAUGAAGCUUCUGACAGUUGGAACUUCAGAAAUUUCUUCCAGAGACAUUGACCCACAUGUUGAAGGUCAGAUAGGCCAAGUGGCAGAAAUGCAAAAAAAUAAGAUAUCUAAGGAUGAUGACAUCAUGAGUGAAGACUUGCCAGGUCAUCAAGGAGACCUCUCUACUUUUUUGCACCAAGAGGGCAAGAGAGAGAAAAUCACCCCUAGAAAUGGAGAACUAUUUCAUUGUGUUUCAGAGAAUGAACAUGGUGCCCCAACCCGGAAGGAUAUGGUUAGGUCAUCCUUUGUAACUAGACACAGCCGAAUCCCUGUUUUAGCACAAGAGAUAGACUCAACUUUGGAAUCAUCCUCUCCAGUUUCUGCAAAAGAAAAGCUCCUCCAAAAGAAAGCCUAUCAGCCAGACCUAGUCAAGCUUCUGGUGGAAAAAAGACAAUUCAAGUCCUUCCUUGGCGACCUCUCAAGUGCCUCUGAUAAAUUGCUAGAGGAGAAACUAGCUACUGUUCCUGCUCCCUUUUGUGAGGAGGAAGUGCUCACUCCCUUUUCAAGACUGACAGUAGAUUCUCACCUGAGUAGGUCAGCUGAAGAUAGCUUUCUGUCACCCAUCAUCUCCCAGUCUAGAAAGAGCAAAAUUCCAAGGCCAGUUUCAUGGGUCAACACAGAUCAGGUCAAUAGCUCAACUUCGUCUCAGUUCUUUCCUCGGCCACCACCAGGAAAGCCACCCACGAGGCCUGGAGUAGAAGCCAGGCUACGCAGAUAUAAAGUCCUAGGGAGUAGUAACUCCGACUCAGACCUUUUCUCCCGCCUGGCCCAAAUUCUUCAAAAUGGAUCUCAGAAACCCCGGAGCACUACUCAGUGCAAGAGUCCAGGAUCUCCUCACAAUCCAAAAACACCACCCAAGAGUCCAGUUGUCCCUCGCAGGAGUCCCAGUGCCUCUCCUCGAAGCUCAUCCUUGCCUCGCACGUCUAGUUCCUCACCAUCUAGGGCUGGACGGCCCCACCAUGACCAGAGGAGUUCGUCCCCACAUCUGGGGAGAAGCAAGUCACCUCCCAGCCACUCAGGAUCUUCCUCCUCCAGGAGGUCCUGCCAACAGGAGCAUUGCAAACCCAGCAAGAAUGGCCUGAAAGGAUCCGGCAGCCUCCACCACCACUCAGCCAGCACUAAAACCCCCCAAGGGAAGAGUAAGCCAGCCAGUAAACUCAGCAGAUAGGAGCCAGGCUGCAUCUCUUUGAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-495.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -528.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 449.15
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......(((((.((....(((((.......)))))......))))))).((((((..(.(((..((((((...(((((....)))))......(((..((..((((((...((((((((((..(((.........((((((.(((.(((...((((.((.(((((((.(.((((((((.....(((((.(((((.....((....((.(.(((((((((..(((((....)))))..((((..........)))).((.((((((((..........(((((.........((((((((((((((((.((((....(((..((((((...((((.((.....((.((.(((((((.(.((((.(((..((((.(((((((.((.(.(((((.(((.((...(((.((((((......((((((.(((((((...((((...((.....))...))))))))))).)))))).((((.......))))((((((((((((((.(.....((((............(((((..(((((.((((((...)))))))))))...)))))...........)))))))))))..))))))))(((((.........(((....)))............))))).....(((((((.....((((....)))).....))))))))))))).)))(((.(((((((((.((....))))))))))))))............(((((((....)))))))........(((.....)))))))).)))))).))..((((((((.(((((.(((((((.(((((..(((((.((((........))))))))).))))).))).)))).))).(((((.........)))))(((((.....))))).(((..((.....)).)))...((.((((((...(((...))))))))).))............)).))))))))((((((((((((((.(((((((((.........)))))).........((((((((....((........((((((((.(((....))).))))))))))...)))))))).....))).)))).))))).)))))...))))))).))))...))).))))...).))))))).))))...((((((.((((....((.(((((.(((..((((.((((..........)))).))))..)))(((((((.((......)))))))))..))))).))))))))))))....(((((((...(.(((......(((..(((((((....)))))..))..)))....))).).)))))))(((............))).))))))...)))))).(((((....))))).)))...)))).))).)))))))......................))))))........)))))))))))).).))......((.((........)).))((.((((((((.(((........))))))))))))).....))))))))).)))..))..))))).)))))(((((...........)))))..((.....))..)))))))).).)))))))(((.....((((....((((.......))))......))))..)))......)).))))...))).))).))))))..........)))....)).))))))))....))..........))))...))..)))))))))))).)..))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.......,{({{.,{.{{{((((({{..,,.|||||{..,,{|,}}}}},,{||{|}}|}|{{..|,{||||.|||||{.,,,,,,,|,,((,.(((,,{(.,(((({(...{(((((((((..(((.........((((((,(((.(((...((((.{,.,((((((.(.((((((((.....(((((.(((((.....((....((.(.(((((((((..{((((....})))}..((((..........)))).,{.{(((((((..........(((((.........((((((((((((((((.((((....,((,.((((((...((({,({.....((.((.(((((((.(.((((.(((..(((({({{((({.{,.(.(((((.(({,{{..,{(({((((((......,|||||}|||(((,...((((...{{.....}|,,,}}}}}}))))}.}|||||{(,((.,,...{|||}{{,,,{{,||||{{}|.}}.}||||},..........(((((..(((((.((((({...}})))))))))...})))),,|,,.,,...||||||,,||,..}),,))))},....({{....}||,,,,,|||..............{|,...||(((((((....,((((....))))}....))))))}|||||}.}}}(((.(((((((((.((....))))))))))))))....,.....,.(((((((....))))))).|||||||||{.....}))))))),)))})}.,,..((((((((.,((((.(((((((.(((((..(((((.((((........))))))))).))))).))).)))).)))}.{(({....,,,,.)))},{((((.....))))}.|||.,||,...{||,|||,|,{{.(({,((,.,{||,..)}})))))}|}}.....,,,....,..)))})))){(((((((((((((.(((((((((.......,.)))))),,.......((((((((,,{.((,......,{|||{|||.{({....))).)))))}))}}...}})))))).,,,.))).)))).))))).))))).,.})))))))))))...))).))))...).))))))).))))...(((((,,((((....((.(((((.{((..((((.((((..........)))).))))..))}(((((((.((......)))))))))..))))).))))))))))))....(((((((...(.(((...{{,(((..{{(((((....)))))..}}..))).}},))).}.))))))),,,..,,,.......,)),))))))...)))))).(((((....))))).,)),..)))).)))}}))))))....................,,)))))),.......)))))))))))).}..},.....((.((........)).))((.((((((({{(((........))))))))))))).....))))))))).)))..)),.))))).)))))(((((...........)))))..((.....))..)))))))).).))))))|((((....)))),.,.((((.......)))}...||{{{||,..}}..,.}|)}.))))},,}))})}}.)))))).........,})}....)),}))))))},.,.|},,,...,|,.,}}}...))..)}})))))}}})})},}}}}}}
Back