Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TTBK2_0003100
Sequence Length
589 nt
GC Content
0.4856
CCUGGAGAAAAUGCAGAAAGAUACCAGUGCAGGAAAAGAAUCUAUUCUCCCUGCUCUGCUGCAUAAGCCUUGCGUUCCUGCUGUGUCCCGUACUGACCACAUCUGGCACUAUGAUGAAGAAUAUCUUCCAGAUGCCUCCAAGCCUGCUUCUGCCAACACCCCUGAGCAGGCAGAUGGUGGUGGCAGCAAUGGAUUUAUAGCUGUUAACCUGAGCUCUUGCAAGCAAGAAAUUGAUUCCAAAGAAUGGGUGAUUGUGGACAAGGAGCAGGACCUUCAGGAUUUUAGGACAAAUGAGGCUGUAGGACAUAAAACAACUGGAAGUCCUUCUGAUGAGGAGCCUGAAGUACUUCAAGUCCUGGAGGCAUCACCUCAAGAUGAAAAGCUCCAGUUAGGUCCUUGGGCAGAAAAUGAUCAUUUAAAGAAGGAAACCUCAGGUGUGGUCUUAGCACUUUCUGCAGAGGGUCCUCCUACUGCUGCUUCAGAACAAUAUACAGAUAGGCUGGAACUCCAGCCUGGAGCUGCUAGUCAGUUUAUUGCAGCGACGCCCACAAGUCUAAUGGAGGCGCAGGCAGAAGGACCCCUUACAGCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-188.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -197.83
Frequency: 0.0000
Diversity: 117.69
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..((.....((((((........(((.(((((...((((....)))).))))).)))))))))...))..)((((.((((((((((((((........(((((((...(((........)))....)))))))((.(((.((((((((..............))))))))...))).))(((((((.(((....))).))))))).((((..(.((((...((((...(((.((((....)))).)))..))))...)))))..)))).((((((((((((.(((((...(.(((((.((((((...............)))))........).))))).).)).))).))))))))))))((((.......))))..((((..((((.(((.((((..(((((((..((((((.....((.((...))))....)))))).......)))))))..)))).)))...))))..))))................((((((((....))))))))..(((((.............)))))(((........)))..)))).)))))).))))((((...))))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..((.....((((((........(((.(((((...((({....}))).))))).)))))))))...))..)((((.((((((((((((((..,{{({{((((((({{.,.{{..(({{{...}))))))},))||.,,,.((((((((..,...........)))))))),||}|||||{((((((.(((....})}.)))))}..((((..(.((((...((((...(((.((((....)))).)))..))))...)))))..)))).((((((((((((.(((((...(.(((((.{(((((...............))))).,.....,).))))).).)).))).)))))))))))){{{{.......))))..{(((..((((.(((.((((..(((((((..(((({{.....{,,((...)))}..,.)))))).......))))))).,)))).)))...))))..)))},...............((((((((....))))))))..(((((.{,.......,,,)))))(((........)))..}))).)))))))}))){(((...))))..})))
Back