Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TTBK2_0003900
Sequence Length
1476 nt
GC Content
0.4661
GUUAAAUGGAAACCACCCUUGGGAACUGGAUGCCUGUGUAGCUGUUCUACCAUAUCAGUGUAUUGCAAUGAGUGGGGGAGGAGAGCAGCUGGAUAUCCUGAGUGUUGGAAUCCUAGUGAAAGAAAGAUGGAAAGUGUUGAGAAAGAUUGGGGGUGGGGGCUUUGGAGAAAUUUACGAUGCCUUGGACAUGCUCACCAGGGAAAAUGUUGCACUGAAGGUGGAAUCAGCUCAACAACCAAAACAAGUUCUGAAAAUGGAAGUUGCUGUUUUGAAAAAGCUGCAAGGGAAAGACCAUGUUUGUAGAUUUAUUGGCUGUGGGAGGAAUGAUCGAUUCAACUAUGUGGUCAUGCAGUUGCAGGGUCGGAAUCUGGCAGAUCUUCGCCGUAGCCAGUCCCGAGGCACAUUCACCAUUAGUACCACUCUCCGGCUGGGUAGACAGAUUUUGGAGUCUAUUGAAAGCAUUCAUUCUGUGGGAUUCUUGCAUCGAGACAUCAAACCGUCGAACUUCGCUAUGGGUCGCUUUCCUAGUACAUGUAGGAAAUGUUACAUGCUUGAUUUUGGCUUGGCUCGACAAUUUACCAAUUCCUGUGGUGACGUCAGACCACCUCGAGCUGUGGCAGGUUUUCGAGGGACAGUUCGUUAUGCAUCAAUCAACGCACAUCGGAACAGGGAAAUGGGAAGACAUGAUGACCUUUGGUCCUUAUUCUACAUGUUGGUGGAGUUUGUGGUUGGUCAGCUGCCCUGGAGAAAAAUAAAGGACAAGGAGCAAGUAGGCUCUAUUAAGGAGAGAUAUGACCACAGGCUCAUGUUGAAACAUCUCCCUCCAGAAUUCAGCAUCUUUCUAGACCAUAUCUCUUCUUUGGAUUAUUUUACAAAACCAGACUACCAGCUUCUUACAUCCGUGUUUGACAAUAGCAUCAAGACUUUUGGAGUAAUUGAGAGUGACCCUUUUGACUGGGAGAAGACUGGAAAUGAUGGCUCCCUAACAACCACCACUACUUCUACCACCCCUCAGUUGCACACUCGCUUGACCCCUGCUGCAAUUGGAAUUGCCAAUGCUACUCCCAUCCCUGGAGACUUGCUUCGAGAAAAUACAGAUGAGGUAUUUCCAGAUGAACAGCUUAGCGAUGGAGAAAAUGGCAUCCCUGUUGGUGUGUCACCAGAUAAAUUGCCUGGAUCUCUGGGACACCCCCGUCCCCAGGAGAAGGAUGUUUGGGAAGAGAUGGAUGCCAACAAAAACAAGAUAAAGCUUGGAAUUUGUAAGGCUGCUACUGAAGAGGAGAACAGCCAUGGCCAGGCAAAUGGUCUUCUCAAUGCUCCAAGCCUUGGGUCACCAAUUCGUGUCCGCUCAGAGAUUACUCAGCCAGACAGAGAUAUUCCACUGGUGCGAAAGUUACGUUCCAUUCACAGCUUUGAGCUGGAAAAACGUCUGACCCUGGAGCCAAAGCCAGACACUGACAAGUUCCUUGAGACCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-433.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -457.78
Frequency: 0.0000
Diversity: 492.55
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.......)))((..((((((((((((((((((((..((((((((..((((.(((.(((...))).)))))))(((((.((.((((((((((.((.(((.(((.(((((((((..(((.(((....(((.((((.........(((((.((((((((((((((..((((((((((..((((((.........))))))....(((((..((((........))))..)))))..((((((((.((((......)))).)...)))))))........(((.((......)).)))))))))))))((((((((((((((((.((.(((((((.(((.(((((........))))).)))..))))).))))..))))).))))))))))).))))))).).)))))).)))))..)))).))).(((.(((((((..........)))))))...))).))).)))..))))))))).)))))).)).))).(((((.((((((((((((((((.......))))..((((((((((..(((((((.((((((....((..(((((.(((...((((((.......)))))).))))).))))))))))))))))))........((((((((.((((((((......((..(.((..((........))..)).)..)))))))))).))...)))))).)))))))))))))))))))))))))))...))))))).))......(((((..(((.(((((((..((((..((((..(((((((((((((.....(((...((((((((...(((......))).))))))))...)))....)))))))))))))))))..................))))..)))))))...))).)))))......(((((((((.....((..(((((((((.(((.(((........)))((((((.(((...((.(((....))).))....))).).)))))..)))..))))))))).))....)))))....))))(((.((((.....)))))))..)))))....(((((((..((((((..............)))))))))))))..))))))))..)))...........))))))).((((((((((.((((((..........((((((((((((((((....((.((((((....(((.(((((((((((......((((.(((((..((((......))))...)))))..(((((((.((....)).))..))))).......)))).....))))))))).)))))....))))))..))......))))))(((..(((....))))))....))))))...)))))))))))....((((((((...(((.(((((...)))))))).)))))..))).((((........))))))))))))))))))).))))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.......)))((..(({(((((((((((((({((.,((((((((,.(({{.(((.(((...})}.)))}}}}{{{{{,||,|||||||{,|,|||{,{{(((.{{{(((((({{(((.(,..{{(((,.,((({{..,,.,,{{(((((((((..(((,(((.(((,,,,,,{.{{((((((.....{{{.,,,)))....(((((..((((........))))..)))))..((((((((.((((......)))).}.,.)))))))...,,.{{((({((......)).,,})))))),})}{{((((((((((((((.((.{{(((((.(({.(((({.,.....,})))).)))..))))).}}))..))))).))))))))))),)))))))}}.))),))}.,))).)))))}}))}{((.{((((((..........))))}}}.,.}}}.,}}.}}}..}}))))})),}}})),,))}}},...|||}|,,.|}}}}||}.||{|,{{{{{||{{...,,,,|||}},.{{{{{{{.{{{{{{...,((,,((((({{({...((((((.......)))))).|||||{|||}|||||||||||}}}..{((((.((((.(((({.{...{{.,,,,{(({{(.{{{{,,{{{.,{{({,.{{(,,..,.}}},,,,.})}.,},)))},,||||||.,,,,,))))})),}))))))))}}))))))))).)))}},{{{,..(((.(((((((..((((.,{{,...{((((((((((((..,..(((...((((((((...(((......))).))))))))...))).,..))))))))))))}|||.,,........,,.}}}}.))))..)))))))...))).|}||}..{...,{{,{((({...,||||,||,|{{{{{|||||{{|.,,{{.,{{(|(((((,.(((...{{.(((....},,.}}....))).}.))))).}},,..,|||||||||},..,||,.,,....,)))||||||||.....|||}}||,.|||}|,,,.(((((((..(((((({............})))))))))))))..)}}}})}}..))).},,......,|||||||.{{(((((((,,{|((((,,,..,..{{(,{,((((((((((,,....}}}||,|||},,,||,.|||||||,|{|..,}}}||||,(((((..((((......))))...)))))..((((({,.((....}).})..)))))...,}}})})),,.}}))))))))},}}))),}},}}}|||.,|},,..,.}||||}(({..(((....)))})),.}}))}}},...,,..}}}}}||,...{,,,|||,,,.{{|,|||||..,))})))}}.,}}}),}))).{|{|,,,,...,)))))))))})},))))))}.}))...))
Back