Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TTBK2_0006400
Sequence Length
1559 nt
GC Content
0.5407
GAGCAAGUAGGCUCUAUUAAGGAGAGAUAUGACCACAGGCUCAUGUUGAAACAUCUCCCUCCAGAAUUCAGCAUCUUUCUAGACCAUAUCUCUUCUUUGGAUUAUUUUACAAAACCAGACUACCAGAUGUCCAUCAGGGUGACCCGGAAGUCCUACAAGGUGUCCACCUCUGGCCCCCAGGCCUUUAACAGCCUCUCCUACACGAGUGGGCCUGGUGCCUGCAUCAGCUCCUCGAGCUUCUCCCGAAUGGGCAGCAGCAGCUUCCGGGGUGGCCUGGGUGCAGGAUAUGGUGGGGCCAGUGGAGGCAUCACCACCAUCACUGUCAACCAAAGCCUGCUGAGCCCUCUUAACCUGGAGGUGGACCCCAACAUCCAGGCCGUGCGCACCCAGGAGGAGAAGCAGAUCAAGACCCUCAACAACAAGUUUUUCUCCUUCAUAGACAAGGUACGGUUCCUGGAGCAGCAGAACAAGAUGCUUGAGACCAAGUGGAGCCUCGUGCAGCAGCAGAAGAUGGCUCGGAGCAACAUGGACAACAUGUUCGAGAGCUACAUCAACAACCUUAAGUGGCAGCUGGAGACUCUGGGCCAGGAGAAGCUGAAGCUGGAGGCGGAGCUUGGCAACAUGCAUGGGCUGGUGGAGGACUUCAGGAACAAGUAUGAGGUUGAGAUCAGUAAAUGUACAGAGAUGGAGAAUGAAUUUGUGCUCAUCAAGGAGUAUGUAGAUGAAGCUUACAUGAACAAGAUGGAGCUGGAGUCUUCCCUGAAAGAGCUGACUGCCAAGAUCAGCUUCCUCAGGCAGCUGUAUGAAGAGGAGAUCGGGAGCUGCAGUCCCAGAUCUCGGAUACAUCUGUGGUGCUGUUCAUGGACAACAGCCGCUUCCUGGACAUGGACAGCAUCAUCCCUGAGGUCAAGGCCAGAGGGCUUCCCUGGAGGCUGCCACGCAGAUACCGAGCAGCGUGGGGAGCUAGCCAUUAAGGAUGCCAAUGCCAAGCUGUCUGAGCUGGAGGCCGCCCUGCAGCUAGCCAGUCAAGACAUGGCGCGGCAGCUGCGUGAGUACCAGGAGCUGAUGAACGUCAAGCUGGCCCUGGAUAUCAAGAUCGCCACCUACAGGAAGCUGUUGGAGGGCGAGGAGAGCUGGCUGGAGUCUGGGAUGCAGAACAUGAGUAUCCAUAUGAAGACCACCAGCAGCUAUGCAGGUGGUCAGAGCUUGGCCUAUGGGGGCCUCACAAGCCCUGGCCUCAGCUACGGCCUGGGCUCCAGCUUUGGCUCUGGCAUGGGCUCCAGCUCCUUCAGCCACACCAGCUCCUCCAGGGCCGUGGUCAUGAAGAAGAUCGAAACCCGUGAUGGGAAGCUAGUGUCUGAGUCCUCCAACGUCCUGCCCAAUUUGAGAAUUACUGCCACACUUCUUACAUCCGUGUUUGACAAUAGCAUCAAGACUUUUGGAGUAAUUGAGAGUGACCCUUUUGACUGGGAGAAGACUGGAAAUGAUGGCUCCCUAACAACCACCACUACUUCUACCACCCCUCAGUUGCACACUCGCUUGACCCCUGCUGCAAUUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-586.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -612.97
Frequency: 0.0000
Diversity: 338.00
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((......))))(...(((((((((((((.....(((...((((((((...(((......))).))))))))...)))....)))))))))))))(((.((........)).)))(((........)))...((((.(..(((((((((......((((....))))..((((....))))...................((((.((((.(((((....))))))))))))).(((.(((((....))).)).))).)))))))))..).))))((((..(((..((((((((..((.((((.(((((...((((((((.((.........((((((...(((((......)))))(((...)))...((((((((((((.......((((((((((..........................)))))))))).........))))))..)))))).))))))......((((.((...((((((...(((((..((..((((......(((((((((((.(((((.....)))))((.((.(((((..............)))))..)).))).))))))))))......))))..))..)))))...))))))...)).))))((((.(((((((((((.(((............(((((((.(((((((..(((((((.............)))))))(((((............)))))...)))).))).......(((((((((((((..(((((..(((((((((....)).)))))))..)))))(((.(((((......((((((((((.......)))).))))))..))))).)))((((((((((((((..((............))..))))))))))))))..(((..(((....)))..)))(((((((...(.(((((..((.......)).))))).))))))))...((.....))((((((..(((((((((...(((((..((((((...(((((((.(((.((((.....))))..))))))))))(((...((((((((((((....))).))))...)))))...)))...(((((.((.((((....)))).))..)))))(((..(((.(.((...((((.....)))).))).))).))).......(((((((.(((....))).)))))))..((((.((((....(((((.......)))))))))..)))).)))))).))))))))).)))))..))))))))))))))))))))))))))((((.(((((((.(((((...(((((........)))))...))).))..))).)))).))))))))))))))))....)).))))........(((((((.(((....((((......(((((.......))))).))))....)))))))))))).)))))(((........))).......)))...))))).)))))).....)).))))))..)))..))))...((((((((.....((.........)))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({..,,,,||||{...(((((((((((((..,..(((...((((((((...(((......))).))))))))...))).,..))))))))))))){((,,,........,,.}},(((........)))...,,((((,{((({{,{{{.......||.||,,}}}|,||{{,.{{{||||.......||||{.......,|||.||||||||{|,,,,)}}}|||||}}}),|||.|||((,,..}}|,||,|||,|||,,,||||||||||({{,{||||,..(((((({(..((.((((.(((((...{{{{((((.(({{||{,,,.((((((...(((((......))))){{{...)),...((((((((((((.......((((((((({.......................})}))))))))))...,.....))))))..)))))),))))))......((((.((...((((((...(((((..((..((((......((((((((((,.(((((.....))))){(.((.(((((..............)))))..)).)}}.))))))))))......))))..))..)))))...))))))...)).)))|((((.(((((((((({{(((............(((((((.,,.,,,...((((({{..,..........)))))||{({{{...,..|{{{{{|}},...,})))})}..,..,,.(((((((((((((..(((((..(((((((((....)).)))))))..)))))(((.(((((......((((((((((.......)))).))))))..))))).)))((((((((((((((..((............))..)))))))))))))).((((..(((....)))..)))),,,,({({{.((((,((((((.,........}.)))))),.})))..))....,))((((((..(((((((((...{{{{(,{((((({,{,{((((((.(((.((((.....))))..)))))))))}(((...((((((((((((....)))},)))...)))))...))}...(((((.{(,((((....)))).))..))))),,.,,{{{{(({{{.|{{{,((((((.........)))))).......(((((((.(((....))).))))))),,|{|||{{||,..,||)))},,.,,|||||}||||..,}},.}))))},))))})))))}})))..)))))))))))))))))))}))))))((((.(((((((.({(((...(((((........)))))...))).})..))),}))).))))))))))))))))....)).)))),...{{{{{{.,..,.,.,...,||||}..,.,{{{({,,,....,,,,)}}}}},.,,)))}||||)))).))))}(((........))).......}))...))))).))))))..,..)),))),},..}}}.,)))))},|||||||,,.....,..}....,)))))),,))))
Back