Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TTBK2_0013300
Sequence Length
576 nt
GC Content
0.3698
GGAAAGACCAUGUUUGUAGAUUUAUUGGCUGUGGGAGGAAUGAUCGAUUCAACUAUGUGGUCAUGCAGUUGCAGGUAGGUUACCUUGAAAACGUAUCUUUAAAUUCUUCAGUUUUGAUCAAAGUAUACAAUUACAGUGAAUAUGAAUAAAAAGUAACAACAAUCUUAGUACCAUGUGAGAAUGUUUUAUACUAUGCAGAUGGAACUGUAUUUAAACAGACUUGAUACAGAUUUUCCAAAAAUGAAAUAAUUGUCUUUGUCCGCUAUUUGAGUUGACCUGUAUCUUUACUGAUUGUCAUCUUUGCAGUUUUCGAUCCCUGCAUGGAUGAGGGGAUAUAAUGUGAAUCUUGCCCCUUCCACCCUUCAUUACCUUAGGGGUUCCAGUUUUCCAUUUGUAUUCUAAAGUAUUGUCUUAGUCUGUUUUGUGCUGCUGCAGAAUACCCAAGACUGAGUAAUGCAUAAAGAACAGAGAUUUAUUUCUUACCAUUCUGGAGGUUGGAAAAUCCAAGAUCUAGGGACCCAUAUCUUGCAAGGGACUUCUUGCUGCAUCAUUCCAUAGUAGAAGUUGGAAGUGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-138.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -149.17
Frequency: 0.0000
Diversity: 142.45
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...((.(((...............)))))((((((((((((((((((((((.((.((((.((.(((((((.(((((.(((........))).))))).........(((....)))(((..(((......)))..)))............((((..((((.(((((........))))).))))...)))).......((((((((((((...........)))))))...))))).........)))))))...)).)))))).))))))))).((((.((((((.......((((((.(((((..........))))).)))))).(((((((((((.(((.((.((((((..................))))))...))..))))).)))))))))...((((((.((((((((((.((.(((....))).)).))...)))))))))))))).))))))))))....))))))))).))))((((((..(((((...)))))..)))))).........)(((((...(((((((.((((..........))))))))))).....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({,.,,.||.,,{{{{{{{{{,{,,.{({{(((((({((((({(((((((((.{{.((((.((.(((((((.(((((.(((........))).)))))........,{{{.,{,|,.(((..(((......)))..)))...,}},.....((((..((((.(((((........))))).))))...))))...,,..((((((((((((.,.........)))))))...))))).....,...}))))))...)).))))}}.))))))))).{{((,{{{{{{,.,....{(((({.(((((..........))))).}))))},(((((((((((.(((.{{.((((((..................))))))...))..)))))))))))))}}...((((((.((((((((((.((.(((....))).)).))...)))))))))))))).}}})))}}}|,{,.,}}}})))).}},}{(((((..(((((...)))))..)))))),.})},})))}}})}})}},,,}}}}}}|||||,.|||||},}}..,,,,)})),})))),
Back