Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_TTBK2_0017400

Sequence Length

401 nt

GC Content

0.3616

GCUGGUCUCGAACUCCUGACCUCAAGAGAUCUGCCUGUCUUGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUAUGAGCCACCAUGCCCAGCUGAAGUAAUUGUUUUCUGUGUGACUAUGGCACAAACUCAGUAUGCAAUGGAUGCAAUGGUUUAUUUUAUUUUUUUUUUAAUUUUUUUAGUUCCAUAGGUUUUUGGGGAACAGAUUGCAGUAGAUUACUGGUUUCAGUUUGUUUUGAAUUUUUAGAGAUUGUCCUUUAUUUUUAGUGUUUUUUAAAAAUUUUUGUCUCUUGAACAUUCCAUCAUUCAUUUUCUGAACAAAAUGCUAAAUUUAUUGUGUGAUAUACAAGGGAGAGCCAUAAUUGUAGGACAUAAUUUCUGUGAAUGAAACAAACUGCCCGACCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-88.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -97.89

Frequency: 0.0000

Diversity: 104.88

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.((((((................)))))).))(((((((((....))))...((((((......(((....)))......))))))....((((((((((((((.....((((((.((((((.((...((((.....)))).))))))..........................)).)))))).....))))))))).)))))((((...))))((...(((((((((((..((((.(((((((((((((..((((((((......))))))))..((.(((((((.....(((((.((..((((...............))))..)).))).))....))))))).))..........))))))..))))))).))))))))))))))).)))).)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((.((((((................)))))).))((((({(((...,|||}...{(((((,.....(((,,,.}}}..,},,))}}}},,..((((((((((((((.,...((((((.{{{{{{,{|||.({({..,..)))}.})))))................||......,,)).)))))).....)))))))))}})))){{{{...}})}((...(((((((((((..((((.(((((((((((((..((((((((......)))))))}..,(.(((((((...,,{.{{{,{,.{({{{,......,}}}}}...,,....,,)}),)},.,.))))))).)}.,.....,,.))))))..))))))).))))))))))))))).),))})))