Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_TTC3_0001900

Sequence Length

630 nt

GC Content

0.3714

UUUGUGUUGUCUCCUUAGACUUGUGCACCAUGGACAAUUUUGCUGAGGGAGAUUUCACUGUGGCGGAUUAUGCCUUGUUAGAAGAUUGCCCUCACGUGGAUGAUUGUGUCUUUGCUGCUGAAUUUAUGAGCAAUGAUUAUGUUCGUGUGACUCAGCUUUACUGUGAUGGGGUGGGUGUGCAAUAUAAAGAUUAUAUCCAAAGUGAGAGGAAUUUGGAAUUUGACAUCUGCAGUAUAUGGUGUAGUAAACCAAUUUCUGUCCUGCAAGAUUAUUGCGAUGCCAUUAAAAUAAACAUCUUCUGGCCACUUCUGUUUCAACAUCAAAACAGUUCCGUAAUAUCACGAUUGCAUCCCUGUGUGGACGCCAACAAUUCACGUGCUUCUGAGAUAAAUUUGAAGAAACUACAACAUCUUGAGUUGAUGGAAGAUAUUGUGGAUUUGGCAAAGAAAGUUGCUAAUGAUUCAUUCCUUAUUGGAGGCUUAUUGAGAAUUGGUUGUAAAAUAGAAAAUAAAAUCUUGGCAAUGGAAGAAGCUCUGAAUUGGAUAAAAUAUGCAGGCGAUGUAACAAUUCUAACUAAAUUAGGAUCAAUUGACAAUUGUUGGCCUAUGUUAAGUAUUUUCUUUACUGAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-151.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -162.71

Frequency: 0.0000

Diversity: 134.55

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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