Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TTC3_0003800
Sequence Length
1244 nt
GC Content
0.3698
ACUUGUGCACCAUGGACAAUUUUGCUGAGGGAGAUUUCACUGUGGCGGAUUAUGCCUUGUUAGAAGAUUGCCCUCACGUGGAUGAUUGUGUCUUUGCUGCUGAAUUUAUGAGCAAUGAUUAUGUUCGUGUGACUCAGCUUUACUGUGAUGGGGUGGGUGUGCAAUAUAAAGAUUAUAUCCAAAGUGAGAGGAAUUUGGAAUUUGACAUCUGCAGUAUAUGGUGUAGUAAACCAAUUUCUGUCCUGCAAGAUUAUUGCGAUGCCAUUAAAAUAAACAUCUUCUGGCCACUUCUGUUUCAACAUCAAAACAGUUCCGUAAUAUCACGAUUGCAUCCCUGUGUGGACGCCAACAAUUCACGUGCUUCUGAGAUAAAUUUGAAGAAACUACAACAUCUUGAGUUGAUGGAAGAUAUUGUGGAUUUGGCAAAGAAAGUUGCUAAUGAUUCAUUCCUUAUUGGAGGCUUAUUGAGAAUUGGUUGUAAAAUAGAAAAUAAAAUCUUGGCAAUGGAAGAAGCUCUGAAUUGGAUAAAAUAUGCAGGCGAUGUAACAAUUCUAACUAAAUUAGGAUCAAUUGACAAUUGUUGGCCUAUGUUAAGUAUUUUCUUUACUGAAUACAAGUACCACAUAACUAAAAUUGUAAUGGAAGACUGCAAUUUGCUUGAAGAACUUAAAACUCAAAGUUGUAUGGAUUGUAUAGAGGAAGGAGAACUAAUGAAAAUGAAAGGAAAUGAAGAGUUUUCCAAAGAAAGAUUUGAUAUAGCUAUUAUCUAUUACACCAGAGCCAUUGAAUAUAGACCUGAAAACUACCUUCUUUAUGGUAACCGAGCUCUUUGUUUUCUUCGUACUGGACAGUUUAGAAAUGCACUCGGUGAUGGAAAGAGAGCCACUAUUCUGAAGAACACUUGGCCAAAGGGUCAUUAUCGUUAUUGUGAUGCUCUUUCUAUGCUGGGGGAAUAUGACUGGGCCCUGCAAGCAAACAUAAAAGCUCAAAAACUCUGUAAAAAUGACCCUGAGGGAAUCAAGGAUCUAAUUCAGCAGCAUGUAAAGUUACAAAAACAAAUAGAAGACCUACAAGGUCGAACAGCAAAUAAGGAUCCAAUUAAAGCCUUUUAUGAAAACAGGGCCUACACACCUAGGAGUUUAUCAGCACCUAUAUUUACUACUUCACUUAACUUUGUGGAGAAGGAAAGAGAUUUCAGAAAAAUUAAUCACGAAAUGGCCAACGGUGGUAAUCAGAAUCUAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-291.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -313.20
Frequency: 0.0000
Diversity: 295.59
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.....(((((((...........((((((.((((((.....((((.....))))......).))))).))))))))))).)).....))(((((..(((((...((((((((.......))))))))....)))))((((...((((((.(((((((((............)))))))..((.((.(((((((.((......(((((..........)))))......))))))))).))))((((.....)))).)).))))))...))))....(((((((((((.((((((........))))))...(((......))).(((((((((((((((........(((((((.(.((((((........((((..(((.((((((.(((((..........))))).)))))).)))..))))..(((((.(((((((........))))))).)))))........((.(((((.....(((........)))..))))).)))))))).)))))))).......)))))))).)))))))..(((((((.....)))))))............(((((((((((((((((.((((((((.((..((((((...(((.((((((.((((((((.........))))))))..((((............)))))))))).))).))))))..))...((((((((.......................))))))))))))))))))))))))))(((.................)))...(((((((((..((((((((((((........))).((((((.....((((((((....(((....)))..))))).))))))))).((((((((((...(((.((..(((.((.....(((((....))))))).)))..)).)))...)))))))))).(((((......((..(((((((((........((((((((((.................((((((...)))..))).((((((......((....((((....)))).............(((((...))))).....))......))))))......)).))))))))....)))))))))..))))))).))))).))))...)))))))))((.((((((........)))))).))((((....))))....................)))))))))))))...)))))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({,{{,.(({{{{|.,||,.,,{,.((((((.((((((,{.,.((((.....))))..|,..)}}}})}.))))))})))).|},,,,.}}(((((,,(((((.{,{(((((((.......)))))))}.}..)))||,,{..{((((((({,((((((((............)))))))}.{(,((,(((({{((({....{{,((((.{{{,,,...}}|||{|...,}}}}}}}}}.)}))|||{...,,))))}}}|||}......,,,,..},}}})|}},,,,.((((((........))))))...|{{.....,))).(((((((((((((((........(((((((.(.((((((........{(((..(((.((((((.(((((..........))))).)))))).)))..)))}..{{(({,(((((((........}}}}})).})}}}........{(.(((((.....{{{........))),.))))).}})))))).)))))))).......)))))))).)))))))..(((((((.....))))))){{{{,....,,}},((({{((((((((((.((((((((.((..((((((...(((.((((((.((((((((.........))))))))..((((............)))})))))).))).))))))..))...((((((((........,........,,....))))))))))))))))))))))))))))}}...|||||||||,,,|,||(((({{{(((((..{{{{,{{{((((........)))}...((({{.,.(((((,(({.{{(..{,.{{{{{.,....,.|.((((({.((((((((((...(((.,{..(((.{(.....(((((....)))))}}.))}..},.)))...)))))))))))))))),.....,}}}}|,,||,||}}}}.}}}||,||,||||}......|||||....,||,{({,{{||,..}},.||{{{{.,,|,,||,,,.{(({....)))}.............(((((...))))).....}}......))))))......,}}}))))}},...,))))))|||....,,||||,||}}.}})),.,)))}}}}}.((.((((((........)))))).)){{{{....||}}.,.........,,....})))))),.,)))))}}})})}}...,}}))
Back