Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TTC3_0007900
Sequence Length
1517 nt
GC Content
0.3830
ACAAGUACCACAUAACUAAAAUUGUAAUGGAAGACUGCAAUUUGCUUGAAGAACUUAAAACUCAAAGUUGUAUGGAUUGUAUAGAGGAAGGAGAACUAAUGAAAAUGAAAGGAAAUGAAGAGUUUUCCAAAGAAAGAUUUGAUAUAGCUAUUAUCUAUUACACCAGAGCCAUUGAAUAUAGACCUGAAAACUACCUUCUUUAUGGUAACCGAGCUCUUUGUUUUCUUCGUACUGGACAGUUUAGAAAUGCACUCGGUGAUGGAAAGAGAGCCACUAUUCUGAAGAACACUUGGCCAAAGGGUCAUUAUCGUUAUUGUGAUGCUCUUUCUAUGCUGGGGGAAUAUGACUGGGCCCUGCAAGCAAACAUAAAAGCUCAAAAACUCUGUAAAAAUGACCCUGAGGGAAUCAAGGAUCUAAUUCAGCAGCAUGUAAAGUUACAAAAACAAAUAGAAGACCUACAAGGUCGAACAGCAAAUAAGGAUCCAAUUAAAGCCUUUUAUGAAAACAGGGCCUACACACCUAGGAGUUUAUCAGCACCUAUAUUUACUACUUCACUUAACUUUGUGGAGAAGGAAAGAGAUUUCAGAAAAAUUAAUCACGAAAUGGCCAACGGUGGUAAUCAGAAUCUAAAGGUGGCGGAUGAGGCGUUGAAGGUAGAUGAUUGUGACUGUCAUCCUGAAUUUUCACCACCAUCAAGUCAGCCUCCAAAACAUAAAGGAAAACAAAAAUCUCGAAACAAUGAAUCAGAAAAGUUCAGUUCUAGUUCACCAUUGACUUUACCAGCAGAUUUGAAGAACAUCUUGGAGAAACAGUUUUCUAAAUCUUCCAGAGCUGCACACCAGGAUUUUGCUAAUAUAAUGAAAAUGCUGAGAAGCUUAAUUCAAGAUGGCUAUAUGGCCUUAUUGGAGCAGCGUUGCCGCAGCGCUGCACAGGCCUUUACAGAGUUGCUGAACGGUUUAGAUCCUCAAAAAAUAAAGCAAUUGAACCUGGCCAUGAUUAACUAUGUUUUGGUCGUCUAUGGACUUGCCAUUUCUCUCCUUGGAAUAGGACAGCCUGAGGAAUUAUCUGAAGCCGAAAACCAGUUUAAGAGGAUUAUUGAACACUACCCCAGUGAGGGCCUUGAUUGCUUGGCCUACUGUGGAAUUGGAAAAGUAUAUUUGAAAAAAAACAGAUUUCUAGAAGCUCUCAAUCACUUUGAGAAAGCAAGAACCUUGAUUUAUCGUCUUCCUGGAGUGUUAACUUGGCCCACGAGUAAUGUGAUUAUUGAAGAGUCUCAGCCACAAAAAAUAAAGAUGCUGUUAGAGAAAUUUGUUGAAGAAUGCAAGUUCCCUCCAGUGCCAGAUGCCAUUUGUUGCUAUCAGAAGUGCCAUGGAUAUUCUAAGAUCCAGAUAUACAUAACUGAUCCAGACUUUAAGGGUUUUAUACGCAUCAGCUGUUGCCAGUACUGUAAAAUAGAAUUUCACAUGAAUUGCUGGAAGAAGUUAAAAACUACAACCUUUAAUGAUAAAAUUGACAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-338.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -370.76
Frequency: 0.0000
Diversity: 444.39
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...(((.((((((.((((((((.........))))))))..((((............)))))))))).))).))))....(((((((.((................(((((........)))))............((((.......)))).....(..(((.(.((((...((((((.........((((........))))...(((((...(((((.(((.(((..((.(((((......(.(.((((((.((((((((((...(((.((..(((.((.....(((((....))))))).)))..)).)))...))))))))))))))))).)....)))))..)).)))))).)))))....)))))......))))))..)))).).)))..)(((((((((.(((..(((((((((.(((((((..................(((((...)))))........(((((((..(((..((.((((.(((.((((...(((.........)))..((((((.((((((..........((.((((((........)))))).))((((....))))..........(((((.............)))))...((((((((...((((...((((..(.((.((((((.((((((.......))))))....)))))))))..))))(((((((..(((..........)))....................(((((.((((........)))).)))))...))))))).....((((.((((((((.....((((((((....)))))))).)))).)))).)))).)))).))))))))...............)))))).))))))..))))))).)))).))))))))))))...(((((((((...)))))))))......)))))))..)))))))))(((((((((((((((....................((((((.(((.......))).)))))).....((.((..(((((((.......))))).))..))))))))))....)))).))))).......((((((........)))))).....((((((..(((((..(....)..))))))))).))...(((((......(((((........))))))))))...((((((((.....))))))..)).))).))))))))).)).)))))))..(((.(((((((...((((((...((((((.......(((((((.(((.(((((..........((((...(((.(((((((........)))))))..)))))))...........))))).)))(((((..(((...(((((........)))))......)))..)))))..)))))))...((((((((..(((...((((....))))..)))...))))))))))))))...))).)))...)))))))..))).......(((((......)))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
...({(.....,,.||,....{{||..||,.,,{{{(((({,,(({{((.{....({{{{(({{{{{{{...((({(({{{{{..,..,{,.,..||.......{({,,,((((((((((((({{,||,,,....,,|,|{{{{....,,,}}}}}.......{{{.{{,{{.,...}|{|..,,,.....{{{{........)))}...}}))))))))))))))))||.(((({,,,(({{{{,,{{({(({{((..({{,..,||.}}|{{..,((((({(((((..(((((..{{{({{(((,|,{.....,||{.{||,||,,,.{((({{(({..{.....}}..))}),},})})..,,.}}.)))))}......,,)},..,}))})})),.}}(((((((((.(((..{((((((((.(((((((.,................(((((...)))))......{.{{(((((..(({..,,.{(((,{{{.{({,...{(({,,,.....}}).,((((({.((((((..,...,{..((.((((((........)))))).)){{||..,,||||.,........,||,,,..,,.(({{...,))))...((((((((...(((({{.({(({{(.(.(((((((,((((((.......)))))).,..})))))),).}),))|,|||,|}}{{{..........}}}...........,,.......(((((.((((........)))).)))))...}))},},.....((((.((((((((.....((((((({....}))))))).))))},))).)))).}})).))))))))...............)))))).})))))..}))}}}}.)))).,,})))))))))},.(((((((((...)))))))))...,,.)))))))..))))))))}(((((((((((((((....................,(((((.(((.......))).)))))},,...{|.|{,||{|{{{(,.,,,,.}}}},,))..)},}))))))....)))))))))).......((((((........)))))).....((((((..(((((..(....)..))))))))).))..,((((({......((({.....,..}}}})))))),..((((((((.....)))))}..)).))).)))))))))..|{|||,||(({((,,,{,(((((.....}}}}},|||,{,,,.,,....,,||{{(((.,{,.........,..}}}}...|}|,{((((((........))))))),,)))))),}..}}}}))))..)))).)).))))}}}}),,.|{{{|.}}}}},,,))))}.,,}}),...,,)))))))))))}..})))))}}....}.}}})}.}}}}||}}}.||{{...,|,,.,||||}||.,...)),)))....||||....}}).}...,,{{{{{......}))}},,,.
Back