Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TTC3_0008400
Sequence Length
2053 nt
GC Content
0.3799
GAAGGAGAACUAAUGAAAAUGAAAGGAAAUGAAGAGUUUUCCAAAGAAAGAUUUGAUAUAGCUAUUAUCUAUUACACCAGAGCCAUUGAAUAUAGACCUGAAAACUACCUUCUUUAUGGUAACCGAGCUCUUUGUUUUCUUCGUACUGGACAGUUUAGAAAUGCACUCGGUGAUGGAAAGAGAGCCACUAUUCUGAAGAACACUUGGCCAAAGGGUCAUUAUCGUUAUUGUGAUGCUCUUUCUAUGCUGGGGGAAUAUGACUGGGCCCUGCAAGCAAACAUAAAAGCUCAAAAACUCUGUAAAAAUGACCCUGAGGGAAUCAAGGAUCUAAUUCAGCAGCAUGUAAAGUUACAAAAACAAAUAGAAGACCUACAAGGUCGAACAGCAAAUAAGGAUCCAAUUAAAGCCUUUUAUGAAAACAGGGCCUACACACCUAGGAGUUUAUCAGCACCUAUAUUUACUACUUCACUUAACUUUGUGGAGAAGGAAAGAGAUUUCAGAAAAAUUAAUCACGAAAUGGCCAACGGUGGUAAUCAGAAUCUAAAGGUGGCGGAUGAGGCGUUGAAGGUAGAUGAUUGUGACUGUCAUCCUGAAUUUUCACCACCAUCAAGUCAGCCUCCAAAACAUAAAGGAAAACAAAAAUCUCGAAACAAUGAAUCAGAAAAGUUCAGUUCUAGUUCACCAUUGACUUUACCAGCAGAUUUGAAGAACAUCUUGGAGAAACAGUUUUCUAAAUCUUCCAGAGCUGCACACCAGGAUUUUGCUAAUAUAAUGAAAAUGCUGAGAAGCUUAAUUCAAGAUGGCUAUAUGGCCUUAUUGGAGCAGCGUUGCCGCAGCGCUGCACAGGCCUUUACAGAGUUGCUGAACGGUUUAGAUCCUCAAAAAAUAAAGCAAUUGAACCUGGCCAUGAUUAACUAUGUUUUGGUCGUCUAUGGACUUGCCAUUUCUCUCCUUGGAAUAGGACAGCCUGAGGAAUUAUCUGAAGCCGAAAACCAGUUUAAGAGGAUUAUUGAACACUACCCCAGUGAGGGCCUUGAUUGCUUGGCCUACUGUGGAAUUGGAAAAGUAUAUUUGAAAAAAAACAGAUUUCUAGAAGCUCUCAAUCACUUUGAGAAAGCAAGAACCUUGAUUUAUCGUCUUCCUGGAGUGUUAACUUGGCCCACGAGUAAUGUGAUUAUUGAAGAGUCUCAGCCACAAAAAAUAAAGAUGCUGUUAGAGAAAUUUGUUGAAGAAUGCAAGUUCCCUCCAGUGCCAGAUGCCAUUUGUUGCUAUCAGAAGUGCCAUGGAUAUUCUAAGAUCCAGAUAUACAUAACUGAUCCAGACUUUAAGGGUUUUAUACGCAUCAGCUGUUGCCAGUACUGUAAAAUAGAAUUUCACAUGAAUUGCUGGAAGAAGUUAAAAACUACAACCUUUAAUGAUAAAAUUGACAAGGAUUUUCUACAAGGAAUAUGUCUUACCCCUGACUGUGAAGGUGUCAUUUCUAAGAUUAUCAUCUUCAGCAGUGGUGGUGAAGUUAAAUGUGAAUUUGAACACAAGGUCAUAAAAGAAAAGGUUCCUCCAAGACCUAUUCUGAAACAGAAAUGUUCUAGCCUAGAGAAACUAAGACUGAAAGAAGACAAAAAAUUGAAGAGAAAGAUCCAAAAAAAAGAAGCAAAAAAGUUAGCACAAGAAAGAAUGGAGGAGGACUUAAGAGAAAGUAAUCCACCCAAAAAUGAAGAGCAGAAAGAAACUGUAGACAAUGUUCAGCGUUGUCAGUUCCUUGAUGACAGAAUUCUACAGUGUAUAAAGCAGUAUGCUGACAAGAUUAAAUCCGGCAUACAGAAUACAGCCAUGCUUCUCAAAGAAUUGCUUUCUUGGAAAGUUUUGAGCACAGAAGACUAUACAACCUGUUUUUCUAGCAGAAAUUUUCUAAAUGAAGCAGUGGACUAUGUUAUUCGCCACUUGAUUCAAGAAAAUAACAGAGUAAAGACAAGAAUAUUUCUGCAUGUUUUGAGUGAGCUUAAAGAAGUGGAGCCCAAAUUAGCCGCCUGGAUCCAAAAACUUAAUAGCUUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-480.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -520.93
Frequency: 0.0000
Diversity: 587.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..((((((((.......................))))))))............((((.......)))).......)((((((.(((((.....(((((......((((........))))..((((...(((((((((((.((..((((..((.......((.(((.((((.(((...(((((((((((((((((....((((((((((....((.((((...((.(((.(((.((((((((.(((((((((....((..(((((((((........((((((((((.................((((((...)))..))).((((((......((....((((....)))).............(((((...))))).....))......))))))......)).))))))))....)))))))))..))))).........)))))).............((((((........))))))..))))))))))).))).))...)))).))....))))))..))))....))))))).....))))))((((((.(.(((..((........))..)))).)))))).....)))).))).)))).))))))).))))..))....)))))))))))...))))......(((((.......)))))((((.(((((((..((((((((((((.((...(((((((..((((((((((...((((((..(..((((((((((((......(((.(((((............))))).)))...))))((((((((((((((....((((...(((((((((((((((...)))))))))...((((.......(((((((......(((.((...)).))).....)))))))......))))((((((((.......))))))))....((((((((.((((.(((((((((...........)))))))..(((((....((((......((((((........)))))).....((((((..(((((..(....)..))))))))).))..))))...)).)))..........(((((((((((...(((((((((.....))))))...((((...))))(((..((((...((..((((....))))))...))))..)))(((....((((......)))).))).............))).....))))))))))))).))))))))))))..))))))))))...)))))))(((...(((((..(((...(((((........)))))......)))..)))))...))).....(((((((((..(((...((((....))))..)))...)))))))))....)))))))))))))))..)..))))))....((((((((......)))))..)))((((((.((((((..((.....))..)))...)))))))))....)))))))))).....)))))))...)).))))))))))))..))))))).))))...))))).....((((.(((((.......))))).))))....((((((((((((.(.((.............((......)).............((......))........(((((((......................(((.(((..((((......))))..)))..)))..........((........((((((((....((((...((((((((....)))))))).)))))))))))).......)).((((((((.............))))))))............)))))))......((((((((.((((((((((((..((...((((((..........))))))...)).))))))))))))..))))))))..(((.(((((((.....((((...))))..))))))).)))..)).).))))))))))))....(((((((....)))))))...((((..(((...........))).)))).....))))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..((((((((..,.....,.........,....))))))))......,{{,.,((((....,,}))))}.,,...)((((((.(((((.,,,,(,,((,,...,((((........)))}..{(((,{.{((((((((((.{(,,(((,.,{{.......,|,,||}|||{,((({,,{{{.({((({(({((((..,.({{{((((({....({.{(({..,{{.{{||{{,.(((((((|.|{(((({{,....{{..(((((((((........((((((((((.................{{{(((...)))..,,,.((((((......((....((({....)))}.............(((((...))))).....))......))))))......))}})))))))....)))))))))..},}})}},.||},.})))}..,,,......{{.((((((........)))))).})))))))).}}})),,}....}))).})....)))))}..)))).,..))))))).....||||||,((((({(,({(({,({{.{{{{{|...,},,,))))),,,,.,,}))},}}}),)),,,}},}),))},..,,....,)))}}})}}}...||||{{{{,.(({,{{,,,,..}}}},((((.(((((((..((((((((((((.((...(((((((..((((((((((..,((((((..{..(((((((({(({.,....(((.(((((............))))).))).,.}))},,,{{{{{(({(((,,..{(((,..{{{({{(((((((((...))))))))).,,|||{,{{,,,,,{{(((({..{{{((({(({{{{{{........,}},}}}......||||(,(((,,,....}},.))))))}....(({{{{{{{{{(({{.{{{{.}},,.,))..}},})))))}....))),}}})}},...,{.{{{{((,..,,,,.}}}}}}....,({((((..(((((..(....}..))))))))).))...|||....{{{,{{{{{......,,{{((((({({{{(,{((((({.{{{,||}}||.{{(((,,..,,||.,..,{{{{{,.{{{|{{(,,,..{((((.....))))},}||||,,,..,,,..,,|||||{{.,|..........,..)))}...,}}}|||||||,...,,,,)))))))}.})))))})}}),}})}))})),||}}},||,|,,|||...{|||,.|||||,,)))))|,},}}),,..}))))}|,||}|,...,}||}}|....{{{...|{,|.,}})))),}))},,,,))),}},}}.,,))}}}},))))))))..}..))))))....(((((({{......}}}||.,}}}{{,((({...,)))}..,|||........,,}..}))))))))..)))))))))).....)))))))...)).))))))))))))..))))))).))))...|||||.....{(((.{{{{|,......))))).)))),...((((((((((((.(,{(((((((((...,.{{......,,.,,.....,|,..{{......}}........,{,{((,.....,,,.,|.{,,,,,,,..{((.(((..((((......))))..))).,)},....,{,.{{((,.......((((((((....((((...((((((({....}))))))).)))))))))))),,.....,}.((((((((.............))))))))............)))))})},....,,|,})))))}|,,,((((((........}}}}}}.........))))))))))).},,|{|||||...({(|,|{((((.{..,...,,,.,)}})||}.})))))}})))..,,.,}}.....,.)))))))))))),,}}}||||||.,.|}}},,,,...|{||,,{|{.....,,,,,,))).))}}.....})))).))))))
Back